RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377689.2

FAM220BP-201, Transcript of family with sequence similarity 220 member B, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene FAM220BP, Length 816 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220BP-201ENST00000377689 NEO1Q92859 1461 aa25.62■■□□□ 1.69
FAM220BP-201ENST00000377689 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.61■■□□□ 1.69
FAM220BP-201ENST00000377689 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.6■■□□□ 1.69
FAM220BP-201ENST00000377689 KDM6BO15054 1643 aa25.59■■□□□ 1.69
FAM220BP-201ENST00000377689 FANCAO15360 1455 aa25.58■■□□□ 1.69
FAM220BP-201ENST00000377689 NCOA2Q15596 1464 aa25.57■■□□□ 1.68
FAM220BP-201ENST00000377689 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
FAM220BP-201ENST00000377689 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
FAM220BP-201ENST00000377689 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.53■■□□□ 1.68
FAM220BP-201ENST00000377689 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.52■■□□□ 1.68
FAM220BP-201ENST00000377689 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.5■■□□□ 1.67
FAM220BP-201ENST00000377689 AKNAQ7Z591 1439 aa25.5■■□□□ 1.67
FAM220BP-201ENST00000377689 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
FAM220BP-201ENST00000377689 RICTORQ6R327 1708 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM220BP-201ENST00000377689 ADGRL1O94910 1474 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM220BP-201ENST00000377689 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.44■■□□□ 1.66
FAM220BP-201ENST00000377689 ABCC1P33527 1531 aa25.42■■□□□ 1.66
FAM220BP-201ENST00000377689 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
FAM220BP-201ENST00000377689 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
FAM220BP-201ENST00000377689 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.4■■□□□ 1.66
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FAM220BP-201ENST00000377689 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.35■■□□□ 1.65
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FAM220BP-201ENST00000377689 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.32■■□□□ 1.64
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FAM220BP-201ENST00000377689 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.27■■□□□ 1.64
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FAM220BP-201ENST00000377689 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.25■■□□□ 1.63
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FAM220BP-201ENST00000377689 MBD5Q9P267 1494 aa25.25■■□□□ 1.63
FAM220BP-201ENST00000377689 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.24■■□□□ 1.63
FAM220BP-201ENST00000377689 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
FAM220BP-201ENST00000377689 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.22■■□□□ 1.63
FAM220BP-201ENST00000377689 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.21■■□□□ 1.63
FAM220BP-201ENST00000377689 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
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FAM220BP-201ENST00000377689 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.19■■□□□ 1.62
FAM220BP-201ENST00000377689 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.19■■□□□ 1.62
FAM220BP-201ENST00000377689 AFAP1Q8N556 730 aa25.19■■□□□ 1.62
FAM220BP-201ENST00000377689 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.19■■□□□ 1.62
FAM220BP-201ENST00000377689 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
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FAM220BP-201ENST00000377689 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.12■■□□□ 1.61
FAM220BP-201ENST00000377689 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.12■■□□□ 1.61
FAM220BP-201ENST00000377689 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.11■■□□□ 1.61
FAM220BP-201ENST00000377689 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
FAM220BP-201ENST00000377689 REREQ9P2R6 1566 aa25.1■■□□□ 1.61
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FAM220BP-201ENST00000377689 ATP10AO60312 1499 aa25.08■■□□□ 1.6
FAM220BP-201ENST00000377689 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.08■■□□□ 1.6
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FAM220BP-201ENST00000377689 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.04■■□□□ 1.6
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FAM220BP-201ENST00000377689 ROCK1Q13464 1354 aa24.86■■□□□ 1.57
FAM220BP-201ENST00000377689 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
FAM220BP-201ENST00000377689 KIF15Q9NS87 1388 aa24.85■■□□□ 1.57
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FAM220BP-201ENST00000377689 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.76■■□□□ 1.55
FAM220BP-201ENST00000377689 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.76■■□□□ 1.55
FAM220BP-201ENST00000377689 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.76■■□□□ 1.55
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