RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.45■■□□□ 1.98
TM7SF3-201ENST00000343028 DAPK1P53355 1430 aa27.44■■□□□ 1.98
TM7SF3-201ENST00000343028 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
TM7SF3-201ENST00000343028 ABCC5O15440 1437 aa27.42■■□□□ 1.98
TM7SF3-201ENST00000343028 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.39■■□□□ 1.98
TM7SF3-201ENST00000343028 ANP32CO43423 234 aa27.38■■□□□ 1.97
TM7SF3-201ENST00000343028 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.37■■□□□ 1.97
TM7SF3-201ENST00000343028 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
TM7SF3-201ENST00000343028 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
TM7SF3-201ENST00000343028 AKNAQ7Z591 1439 aa27.34■■□□□ 1.97
TM7SF3-201ENST00000343028 KIF14Q15058 1648 aa27.33■■□□□ 1.97
TM7SF3-201ENST00000343028 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TM7SF3-201ENST00000343028 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.32■■□□□ 1.96
TM7SF3-201ENST00000343028 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
TM7SF3-201ENST00000343028 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
TM7SF3-201ENST00000343028 NUP160Q12769 1436 aa27.28■■□□□ 1.96
TM7SF3-201ENST00000343028 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.28■■□□□ 1.96
TM7SF3-201ENST00000343028 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
TM7SF3-201ENST00000343028 ROCK1Q13464 1354 aa27.26■■□□□ 1.95
TM7SF3-201ENST00000343028 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.25■■□□□ 1.95
TM7SF3-201ENST00000343028 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.23■■□□□ 1.95
TM7SF3-201ENST00000343028 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.21■■□□□ 1.95
TM7SF3-201ENST00000343028 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
TM7SF3-201ENST00000343028 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.21■■□□□ 1.95
TM7SF3-201ENST00000343028 NCOA1Q15788 1441 aa27.17■■□□□ 1.94
TM7SF3-201ENST00000343028 BCANQ96GW7 911 aa27.16■■□□□ 1.94
TM7SF3-201ENST00000343028 ATP10BO94823 1461 aa27.16■■□□□ 1.94
TM7SF3-201ENST00000343028 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
TM7SF3-201ENST00000343028 CCER2I3L3R5 266 aa27.15■■□□□ 1.94
TM7SF3-201ENST00000343028 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.12■■□□□ 1.93
TM7SF3-201ENST00000343028 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.12■■□□□ 1.937e-7■■□□□ 11.9
TM7SF3-201ENST00000343028 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
TM7SF3-201ENST00000343028 PKD2Q13563 968 aa27.1■■□□□ 1.93
TM7SF3-201ENST00000343028 PZPP20742 1482 aa27.09■■□□□ 1.93
TM7SF3-201ENST00000343028 ABCA8O94911 1581 aa27.09■■□□□ 1.93
TM7SF3-201ENST00000343028 PTPRGP23470 1445 aa27.08■■□□□ 1.93
TM7SF3-201ENST00000343028 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
TM7SF3-201ENST00000343028 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.06■■□□□ 1.92
TM7SF3-201ENST00000343028 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.06■■□□□ 1.92
TM7SF3-201ENST00000343028 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.05■■□□□ 1.92
TM7SF3-201ENST00000343028 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.05■■□□□ 1.92
TM7SF3-201ENST00000343028 FKBP8Q14318 412 aa27.04■■□□□ 1.92
TM7SF3-201ENST00000343028 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.03■■□□□ 1.92
TM7SF3-201ENST00000343028 TSPY4P0CV99 314 aa27.02■■□□□ 1.92
TM7SF3-201ENST00000343028 TSPY10P0CW01 314 aa27.02■■□□□ 1.92
TM7SF3-201ENST00000343028 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.01■■□□□ 1.91
TM7SF3-201ENST00000343028 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.01■■□□□ 1.91
TM7SF3-201ENST00000343028 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27■■□□□ 1.91
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC184Q52MB2 194 aa27■■□□□ 1.91
TM7SF3-201ENST00000343028 NUP155O75694 1391 aa26.99■■□□□ 1.91
TM7SF3-201ENST00000343028 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.99■■□□□ 1.91
TM7SF3-201ENST00000343028 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.98■■□□□ 1.91
TM7SF3-201ENST00000343028 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
TM7SF3-201ENST00000343028 ADGRL2O95490 1459 aa26.96■■□□□ 1.91
TM7SF3-201ENST00000343028 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.96■■□□□ 1.91
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC7Q96M83 1385 aa26.96■■□□□ 1.91
TM7SF3-201ENST00000343028 CHD1O14646 1710 aa26.95■■□□□ 1.9
TM7SF3-201ENST00000343028 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.92■■□□□ 1.9
TM7SF3-201ENST00000343028 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.92■■□□□ 1.9
TM7SF3-201ENST00000343028 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.91■■□□□ 1.9
TM7SF3-201ENST00000343028 KIF15Q9NS87 1388 aa26.9■■□□□ 1.9
TM7SF3-201ENST00000343028 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.89■■□□□ 1.89
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.86■■□□□ 1.89
TM7SF3-201ENST00000343028 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.84■■□□□ 1.89
TM7SF3-201ENST00000343028 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.84■■□□□ 1.89
TM7SF3-201ENST00000343028 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
TM7SF3-201ENST00000343028 NEFLP07196 543 aa26.84■■□□□ 1.89
TM7SF3-201ENST00000343028 MBD5Q9P267 1494 aa26.82■■□□□ 1.88
TM7SF3-201ENST00000343028 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.81■■□□□ 1.88
TM7SF3-201ENST00000343028 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.81■■□□□ 1.88
TM7SF3-201ENST00000343028 USP47Q96K76 1375 aa26.8■■□□□ 1.88
TM7SF3-201ENST00000343028 MRS2Q9HD23 443 aa26.8■■□□□ 1.88
TM7SF3-201ENST00000343028 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
TM7SF3-201ENST00000343028 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.79■■□□□ 1.88
TM7SF3-201ENST00000343028 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.79■■□□□ 1.88
TM7SF3-201ENST00000343028 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.76■■□□□ 1.87
TM7SF3-201ENST00000343028 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.75■■□□□ 1.87
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.75■■□□□ 1.87
TM7SF3-201ENST00000343028 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.75■■□□□ 1.87
TM7SF3-201ENST00000343028 RGL3Q3MIN7 710 aa26.74■■□□□ 1.87
TM7SF3-201ENST00000343028 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.74■■□□□ 1.87
TM7SF3-201ENST00000343028 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.74■■□□□ 1.87
TM7SF3-201ENST00000343028 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.72■■□□□ 1.87
TM7SF3-201ENST00000343028 PREX2Q70Z35 1606 aa26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3-201ENST00000343028 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.7■■□□□ 1.87
TM7SF3-201ENST00000343028 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.86
TM7SF3-201ENST00000343028 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.69■■□□□ 1.86
TM7SF3-201ENST00000343028 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.66■■□□□ 1.86
TM7SF3-201ENST00000343028 SHROOM2Q13796 1616 aa26.65■■□□□ 1.86
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.64■■□□□ 1.86
TM7SF3-201ENST00000343028 ABCC2Q92887 1545 aa26.62■■□□□ 1.85
TM7SF3-201ENST00000343028 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.61■■□□□ 1.85
TM7SF3-201ENST00000343028 KDM5CP41229 1560 aa26.61■■□□□ 1.85
TM7SF3-201ENST00000343028 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.6■■□□□ 1.85
TM7SF3-201ENST00000343028 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
TM7SF3-201ENST00000343028 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.59■■□□□ 1.85
TM7SF3-201ENST00000343028 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
TM7SF3-201ENST00000343028 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.58■■□□□ 1.85
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms