RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.15■■□□□ 1.94
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SPNS2-201ENST00000329078 RGL3Q3MIN7 710 aa27.14■■□□□ 1.94
SPNS2-201ENST00000329078 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
SPNS2-201ENST00000329078 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.14■■□□□ 1.93
SPNS2-201ENST00000329078 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS2-201ENST00000329078 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
SPNS2-201ENST00000329078 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
SPNS2-201ENST00000329078 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.08■■□□□ 1.93
SPNS2-201ENST00000329078 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.07■■□□□ 1.92
SPNS2-201ENST00000329078 KDM6BO15054 1643 aa27.06■■□□□ 1.92
SPNS2-201ENST00000329078 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.05■■□□□ 1.92
SPNS2-201ENST00000329078 TSPY4P0CV99 314 aa27.04■■□□□ 1.92
SPNS2-201ENST00000329078 TSPY10P0CW01 314 aa27.04■■□□□ 1.92
SPNS2-201ENST00000329078 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
SPNS2-201ENST00000329078 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.04■■□□□ 1.92
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC7Q96M83 1385 aa27.04■■□□□ 1.92
SPNS2-201ENST00000329078 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.03■■□□□ 1.92
SPNS2-201ENST00000329078 JPH4Q96JJ6 628 aa27.03■■□□□ 1.92
SPNS2-201ENST00000329078 ERCC6Q03468 1493 aa27.02■■□□□ 1.92
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SPNS2-201ENST00000329078 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.02■■□□□ 1.92
SPNS2-201ENST00000329078 TMC1Q8TDI8 760 aa27.02■■□□□ 1.92
SPNS2-201ENST00000329078 IQGAP2Q13576 1575 aa27.01■■□□□ 1.91
SPNS2-201ENST00000329078 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.01■■□□□ 1.91
SPNS2-201ENST00000329078 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.99■■□□□ 1.91
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SPNS2-201ENST00000329078 DAPK1P53355 1430 aa26.97■■□□□ 1.91
SPNS2-201ENST00000329078 NUP155O75694 1391 aa26.96■■□□□ 1.91
SPNS2-201ENST00000329078 ABCC5O15440 1437 aa26.95■■□□□ 1.91
SPNS2-201ENST00000329078 HECW1Q76N89 1606 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS2-201ENST00000329078 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.94■■□□□ 1.9
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.93■■□□□ 1.9
SPNS2-201ENST00000329078 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.92■■□□□ 1.9
SPNS2-201ENST00000329078 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.92■■□□□ 1.9
SPNS2-201ENST00000329078 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
SPNS2-201ENST00000329078 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.89■■□□□ 1.89
SPNS2-201ENST00000329078 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
SPNS2-201ENST00000329078 MIA2Q96PC5 1412 aa26.89■■□□□ 1.89
SPNS2-201ENST00000329078 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.88■■□□□ 1.89
SPNS2-201ENST00000329078 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.88■■□□□ 1.89
SPNS2-201ENST00000329078 USP47Q96K76 1375 aa26.86■■□□□ 1.89
SPNS2-201ENST00000329078 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SPNS2-201ENST00000329078 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
SPNS2-201ENST00000329078 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SPNS2-201ENST00000329078 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.81■■□□□ 1.88
SPNS2-201ENST00000329078 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.8■■□□□ 1.88
SPNS2-201ENST00000329078 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.78■■□□□ 1.88
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SPNS2-201ENST00000329078 WDR62O43379 1518 aa26.77■■□□□ 1.88
SPNS2-201ENST00000329078 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.77■■□□□ 1.88
SPNS2-201ENST00000329078 NCOA1Q15788 1441 aa26.76■■□□□ 1.87
SPNS2-201ENST00000329078 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SPNS2-201ENST00000329078 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.74■■□□□ 1.87
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SPNS2-201ENST00000329078 AKNAQ7Z591 1439 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.74■■□□□ 1.87
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SPNS2-201ENST00000329078 DISP1Q96F81 1524 aa26.72■■□□□ 1.87
SPNS2-201ENST00000329078 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SPNS2-201ENST00000329078 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.72■■□□□ 1.87
SPNS2-201ENST00000329078 PBRM1Q86U86 1689 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS2-201ENST00000329078 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SPNS2-201ENST00000329078 GRIN2AQ12879 1464 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS2-201ENST00000329078 IFT140Q96RY7 1462 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS2-201ENST00000329078 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.7■■□□□ 1.87
SPNS2-201ENST00000329078 ARHGEF11O15085 1522 aa26.7■■□□□ 1.86
SPNS2-201ENST00000329078 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SPNS2-201ENST00000329078 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS2-201ENST00000329078 ROCK1Q13464 1354 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS2-201ENST00000329078 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SPNS2-201ENST00000329078 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
SPNS2-201ENST00000329078 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.64■■□□□ 1.86
SPNS2-201ENST00000329078 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
SPNS2-201ENST00000329078 KIF15Q9NS87 1388 aa26.62■■□□□ 1.85
SPNS2-201ENST00000329078 NUDCQ9Y266 331 aa26.62■■□□□ 1.85
SPNS2-201ENST00000329078 KIAA0556O60303 1618 aa26.6■■□□□ 1.85
SPNS2-201ENST00000329078 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.6■■□□□ 1.85
SPNS2-201ENST00000329078 PZPP20742 1482 aa26.58■■□□□ 1.85
SPNS2-201ENST00000329078 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.57■■□□□ 1.84
SPNS2-201ENST00000329078 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.57■■□□□ 1.84
SPNS2-201ENST00000329078 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
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SPNS2-201ENST00000329078 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.56■■□□□ 1.84
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SPNS2-201ENST00000329078 KIF14Q15058 1648 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS2-201ENST00000329078 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SPNS2-201ENST00000329078 PLIN1O60240 522 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS2-201ENST00000329078 IL27Q8NEV9 243 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS2-201ENST00000329078 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS2-201ENST00000329078 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS2-201ENST00000329078 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SPNS2-201ENST00000329078 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.47■■□□□ 1.83
SPNS2-201ENST00000329078 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SPNS2-201ENST00000329078 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
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