RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328649.10

CIB1-201, Transcript of calcium and integrin binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CIB1, Length 1,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB1-201ENST00000328649 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.44■■■■■ 4.22
CIB1-201ENST00000328649 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.43■■■■■ 4.22
CIB1-201ENST00000328649 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
CIB1-201ENST00000328649 PLCH2O75038 1416 aa41.38■■■■■ 4.22
CIB1-201ENST00000328649 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.37■■■■■ 4.21
CIB1-201ENST00000328649 NCOA2Q15596 1464 aa41.36■■■■■ 4.21
CIB1-201ENST00000328649 PTPRMP28827 1452 aa41.34■■■■■ 4.21
CIB1-201ENST00000328649 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.33■■■■■ 4.21
CIB1-201ENST00000328649 FANCAO15360 1455 aa41.33■■■■■ 4.21
CIB1-201ENST00000328649 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.33■■■■■ 4.21
CIB1-201ENST00000328649 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.31■■■■■ 4.2
CIB1-201ENST00000328649 PREX2Q70Z35 1606 aa41.31■■■■■ 4.2
CIB1-201ENST00000328649 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.29■■■■■ 4.2
CIB1-201ENST00000328649 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
CIB1-201ENST00000328649 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.28■■■■■ 4.2
CIB1-201ENST00000328649 RICTORQ6R327 1708 aa41.27■■■■■ 4.2
CIB1-201ENST00000328649 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
CIB1-201ENST00000328649 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.27■■■■■ 4.2
CIB1-201ENST00000328649 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
CIB1-201ENST00000328649 AKNAQ7Z591 1439 aa41.23■■■■■ 4.19
CIB1-201ENST00000328649 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.21■■■■■ 4.19
CIB1-201ENST00000328649 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
CIB1-201ENST00000328649 MADDQ8WXG6 1647 aa41.21■■■■■ 4.19
CIB1-201ENST00000328649 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.2■■■■■ 4.19
CIB1-201ENST00000328649 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.2■■■■■ 4.19
CIB1-201ENST00000328649 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.19
CIB1-201ENST00000328649 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.08■■■■■ 4.17
CIB1-201ENST00000328649 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.07■■■■■ 4.16
CIB1-201ENST00000328649 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.07■■■■■ 4.16
CIB1-201ENST00000328649 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
CIB1-201ENST00000328649 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.05■■■■■ 4.16
CIB1-201ENST00000328649 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
CIB1-201ENST00000328649 ABCC1P33527 1531 aa41■■■■■ 4.15
CIB1-201ENST00000328649 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41■■■■■ 4.15
CIB1-201ENST00000328649 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.99■■■■■ 4.15
CIB1-201ENST00000328649 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.99■■■■■ 4.15
CIB1-201ENST00000328649 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.98■■■■■ 4.15
CIB1-201ENST00000328649 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.96■■■■■ 4.15
CIB1-201ENST00000328649 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.95■■■■■ 4.15
CIB1-201ENST00000328649 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.94■■■■■ 4.14
CIB1-201ENST00000328649 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.94■■■■■ 4.14
CIB1-201ENST00000328649 MIA2Q96PC5 1412 aa40.93■■■■■ 4.14
CIB1-201ENST00000328649 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.93■■■■■ 4.14
CIB1-201ENST00000328649 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.93■■■■■ 4.14
CIB1-201ENST00000328649 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.93■■■■■ 4.14
CIB1-201ENST00000328649 FBXO41Q8TF61 875 aa40.9■■■■■ 4.14
CIB1-201ENST00000328649 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.9■■■■■ 4.14
CIB1-201ENST00000328649 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.87■■■■■ 4.13
CIB1-201ENST00000328649 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.87■■■■■ 4.13
CIB1-201ENST00000328649 AFAP1Q8N556 730 aa40.86■■■■■ 4.13
CIB1-201ENST00000328649 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.85■■■■■ 4.13
CIB1-201ENST00000328649 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.84■■■■■ 4.13
CIB1-201ENST00000328649 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.8■■■■■ 4.12
CIB1-201ENST00000328649 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.79■■■■■ 4.12
CIB1-201ENST00000328649 MLECQ14165 292 aa40.76■■■■■ 4.12
CIB1-201ENST00000328649 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
CIB1-201ENST00000328649 MBD5Q9P267 1494 aa40.76■■■■■ 4.12
CIB1-201ENST00000328649 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.75■■■■■ 4.11
CIB1-201ENST00000328649 ATP10AO60312 1499 aa40.74■■■■■ 4.11
CIB1-201ENST00000328649 KDM5CP41229 1560 aa40.74■■■■■ 4.11
CIB1-201ENST00000328649 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
CIB1-201ENST00000328649 HSPA2P54652 639 aa40.73■■■■■ 4.11
CIB1-201ENST00000328649 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.7■■■■■ 4.11
CIB1-201ENST00000328649 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
CIB1-201ENST00000328649 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.68■■■■■ 4.1
CIB1-201ENST00000328649 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.68■■■■■ 4.1
CIB1-201ENST00000328649 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.66■■■■■ 4.1
CIB1-201ENST00000328649 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.62■■■■■ 4.09
CIB1-201ENST00000328649 TSPY4P0CV99 314 aa40.59■■■■■ 4.09
CIB1-201ENST00000328649 TSPY10P0CW01 314 aa40.59■■■■■ 4.09
CIB1-201ENST00000328649 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.58■■■■■ 4.09
CIB1-201ENST00000328649 ATP7AQ04656 1500 aa40.57■■■■■ 4.09
CIB1-201ENST00000328649 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
CIB1-201ENST00000328649 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
CIB1-201ENST00000328649 ABCC5O15440 1437 aa40.54■■■■■ 4.08
CIB1-201ENST00000328649 DAPK1P53355 1430 aa40.54■■■■■ 4.08
CIB1-201ENST00000328649 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
CIB1-201ENST00000328649 ABCA6Q8N139 1617 aa40.52■■■■■ 4.08
CIB1-201ENST00000328649 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.51■■■■■ 4.08
CIB1-201ENST00000328649 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.5■■■■■ 4.07
CIB1-201ENST00000328649 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.5■■■■■ 4.07
CIB1-201ENST00000328649 ITGAEP38570 1179 aa40.47■■■■■ 4.07
CIB1-201ENST00000328649 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
CIB1-201ENST00000328649 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.47■■■■■ 4.07
CIB1-201ENST00000328649 REREQ9P2R6 1566 aa40.45■■■■■ 4.07
CIB1-201ENST00000328649 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.44■■■■■ 4.06
CIB1-201ENST00000328649 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.44■■■■■ 4.06
CIB1-201ENST00000328649 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
CIB1-201ENST00000328649 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.064e-7■■□□□ 12.1
CIB1-201ENST00000328649 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.43■■■■■ 4.06
CIB1-201ENST00000328649 CERKQ8TCT0 537 aa40.36■■■■■ 4.05
CIB1-201ENST00000328649 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.35■■■■■ 4.05
CIB1-201ENST00000328649 A2MP01023 1474 aa40.32■■■■■ 4.05
CIB1-201ENST00000328649 STRCQ7RTU9 1775 aa40.32■■■■■ 4.04
CIB1-201ENST00000328649 PTPRKQ15262 1439 aa40.32■■■■■ 4.04
CIB1-201ENST00000328649 AGLP35573 1532 aa40.32■■■■■ 4.04
CIB1-201ENST00000328649 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.3■■■■■ 4.04
CIB1-201ENST00000328649 PLXNC1O60486 1568 aa40.3■■■■■ 4.04
CIB1-201ENST00000328649 C3P01024 1663 aa40.3■■■■■ 4.04
CIB1-201ENST00000328649 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.29■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.7 ms