RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.56■■□□□ 1.04
PACS1-201ENST00000320580 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PACS1-201ENST00000320580 CUX1P39880 1505 aa21.51■■□□□ 1.03
PACS1-201ENST00000320580 MS4A1P11836 297 aa21.51■■□□□ 1.03
PACS1-201ENST00000320580 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.5■■□□□ 1.03
PACS1-201ENST00000320580 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
PACS1-201ENST00000320580 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PACS1-201ENST00000320580 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.48■■□□□ 1.03
PACS1-201ENST00000320580 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PACS1-201ENST00000320580 ZMYND15Q9H091 742 aa21.46■■□□□ 1.03
PACS1-201ENST00000320580 CCDC184Q52MB2 194 aa21.46■■□□□ 1.03
PACS1-201ENST00000320580 IGF1RP08069 1367 aa21.46■■□□□ 1.03
PACS1-201ENST00000320580 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.44■■□□□ 1.02
PACS1-201ENST00000320580 PLIN1O60240 522 aa21.43■■□□□ 1.02
PACS1-201ENST00000320580 AKNAQ7Z591 1439 aa21.43■■□□□ 1.02
PACS1-201ENST00000320580 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PACS1-201ENST00000320580 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PACS1-201ENST00000320580 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PACS1-201ENST00000320580 BACH2Q9BYV9 841 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS1-201ENST00000320580 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PACS1-201ENST00000320580 TOP2BQ02880 1626 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS1-201ENST00000320580 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS1-201ENST00000320580 FAM161AQ3B820 660 aa21.38■■□□□ 1.01
PACS1-201ENST00000320580 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.37■■□□□ 1.01
PACS1-201ENST00000320580 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.017e-7■■■■□ 26.5
PACS1-201ENST00000320580 TOPBP1Q92547 1522 aa21.36■■□□□ 1.01
PACS1-201ENST00000320580 WDR97A6NE52 1622 aa21.36■■□□□ 1.01
PACS1-201ENST00000320580 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PACS1-201ENST00000320580 FOXD1Q16676 465 aa21.36■■□□□ 1.01
PACS1-201ENST00000320580 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PACS1-201ENST00000320580 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.33■■□□□ 1.01
PACS1-201ENST00000320580 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
PACS1-201ENST00000320580 CRBNQ96SW2 442 aa21.33■■□□□ 1.01
PACS1-201ENST00000320580 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
PACS1-201ENST00000320580 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.32■■□□□ 1
PACS1-201ENST00000320580 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PACS1-201ENST00000320580 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.3■■□□□ 1
PACS1-201ENST00000320580 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PACS1-201ENST00000320580 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PACS1-201ENST00000320580 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.26■□□□□ 0.99
PACS1-201ENST00000320580 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.26■□□□□ 0.99
PACS1-201ENST00000320580 HSCBQ8IWL3 235 aa21.25■□□□□ 0.99
PACS1-201ENST00000320580 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.25■□□□□ 0.99
PACS1-201ENST00000320580 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
PACS1-201ENST00000320580 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
PACS1-201ENST00000320580 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.24■□□□□ 0.99
PACS1-201ENST00000320580 KIF21BO75037 1637 aa21.23■□□□□ 0.99
PACS1-201ENST00000320580 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.23■□□□□ 0.99
PACS1-201ENST00000320580 PDE3BQ13370 1112 aa21.23■□□□□ 0.99
PACS1-201ENST00000320580 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.22■□□□□ 0.99
PACS1-201ENST00000320580 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
PACS1-201ENST00000320580 POGKQ9P215 609 aa21.2■□□□□ 0.98
PACS1-201ENST00000320580 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.19■□□□□ 0.98
PACS1-201ENST00000320580 SKAP1Q86WV1 359 aa21.19■□□□□ 0.98
PACS1-201ENST00000320580 CCDC7Q96M83 1385 aa21.19■□□□□ 0.98
PACS1-201ENST00000320580 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
PACS1-201ENST00000320580 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.19■□□□□ 0.98
PACS1-201ENST00000320580 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.18■□□□□ 0.98
PACS1-201ENST00000320580 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PACS1-201ENST00000320580 RALBP1Q15311 655 aa21.15■□□□□ 0.98
PACS1-201ENST00000320580 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.15■□□□□ 0.98
PACS1-201ENST00000320580 PRXQ9BXM0 1461 aa21.15■□□□□ 0.98
PACS1-201ENST00000320580 GBP4Q96PP9 640 aa21.14■□□□□ 0.97
PACS1-201ENST00000320580 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.14■□□□□ 0.97
PACS1-201ENST00000320580 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.13■□□□□ 0.97
PACS1-201ENST00000320580 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PACS1-201ENST00000320580 NEUROD2Q15784 382 aa21.11■□□□□ 0.97
PACS1-201ENST00000320580 JPH4Q96JJ6 628 aa21.11■□□□□ 0.97
PACS1-201ENST00000320580 NLRP13Q86W25 1043 aa21.1■□□□□ 0.97
PACS1-201ENST00000320580 FMN1Q68DA7 1419 aa21.1■□□□□ 0.97
PACS1-201ENST00000320580 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PACS1-201ENST00000320580 MRE11P49959 708 aa21.1■□□□□ 0.97
PACS1-201ENST00000320580 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PACS1-201ENST00000320580 TPM2P07951 284 aa21.08■□□□□ 0.97
PACS1-201ENST00000320580 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.08■□□□□ 0.97
PACS1-201ENST00000320580 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.07■□□□□ 0.96
PACS1-201ENST00000320580 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.07■□□□□ 0.96
PACS1-201ENST00000320580 RGL3Q3MIN7 710 aa21.06■□□□□ 0.96
PACS1-201ENST00000320580 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.06■□□□□ 0.96
PACS1-201ENST00000320580 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PACS1-201ENST00000320580 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.06■□□□□ 0.96
PACS1-201ENST00000320580 ESPNB1AK53 854 aa21.05■□□□□ 0.96
PACS1-201ENST00000320580 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.04■□□□□ 0.96
PACS1-201ENST00000320580 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.04■□□□□ 0.96
PACS1-201ENST00000320580 PLCB2Q00722 1185 aa21.04■□□□□ 0.96
PACS1-201ENST00000320580 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PACS1-201ENST00000320580 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.04■□□□□ 0.96
PACS1-201ENST00000320580 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.04■□□□□ 0.96
PACS1-201ENST00000320580 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.03■□□□□ 0.96
PACS1-201ENST00000320580 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.02■□□□□ 0.96
PACS1-201ENST00000320580 TRAK2O60296 914 aa21.02■□□□□ 0.96
PACS1-201ENST00000320580 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
PACS1-201ENST00000320580 ARAP1Q96P48 1450 aa21.01■□□□□ 0.95
PACS1-201ENST00000320580 PLEKHG5O94827 1062 aa21.01■□□□□ 0.95
PACS1-201ENST00000320580 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
PACS1-201ENST00000320580 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21■□□□□ 0.95
PACS1-201ENST00000320580 GRIN2BQ13224 1484 aa21■□□□□ 0.95
PACS1-201ENST00000320580 GOLGA2Q08379 1002 aa21■□□□□ 0.95
PACS1-201ENST00000320580 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21■□□□□ 0.95
PACS1-201ENST00000320580 KIF15Q9NS87 1388 aa20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms