RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318074.9

SYTL1-201, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYTL1, Length 1,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-201ENST00000318074 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
SYTL1-201ENST00000318074 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.22■■■□□ 2.27
SYTL1-201ENST00000318074 PREX2Q70Z35 1606 aa29.22■■■□□ 2.27
SYTL1-201ENST00000318074 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.21■■■□□ 2.27
SYTL1-201ENST00000318074 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.2■■■□□ 2.27
SYTL1-201ENST00000318074 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.2■■■□□ 2.26
SYTL1-201ENST00000318074 CD109Q6YHK3 1445 aa29.19■■■□□ 2.26
SYTL1-201ENST00000318074 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.17■■■□□ 2.26
SYTL1-201ENST00000318074 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.16■■■□□ 2.26
SYTL1-201ENST00000318074 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.15■■■□□ 2.26
SYTL1-201ENST00000318074 GLI2P10070 1586 aa29.13■■■□□ 2.25
SYTL1-201ENST00000318074 DIP2BQ9P265 1576 aa29.12■■■□□ 2.25
SYTL1-201ENST00000318074 FANCAO15360 1455 aa29.1■■■□□ 2.25
SYTL1-201ENST00000318074 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.08■■■□□ 2.25
SYTL1-201ENST00000318074 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.07■■■□□ 2.24
SYTL1-201ENST00000318074 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.24
SYTL1-201ENST00000318074 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.04■■■□□ 2.24
SYTL1-201ENST00000318074 DAPK1P53355 1430 aa29.04■■■□□ 2.24
SYTL1-201ENST00000318074 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.04■■■□□ 2.24
SYTL1-201ENST00000318074 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.04■■■□□ 2.24
SYTL1-201ENST00000318074 ABCC5O15440 1437 aa29.03■■■□□ 2.24
SYTL1-201ENST00000318074 PTPRKQ15262 1439 aa29.01■■■□□ 2.24
SYTL1-201ENST00000318074 MBD5Q9P267 1494 aa29■■■□□ 2.23
SYTL1-201ENST00000318074 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
SYTL1-201ENST00000318074 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29■■■□□ 2.23
SYTL1-201ENST00000318074 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.99■■■□□ 2.23
SYTL1-201ENST00000318074 AKNAQ7Z591 1439 aa28.98■■■□□ 2.23
SYTL1-201ENST00000318074 TSPY4P0CV99 314 aa28.98■■■□□ 2.23
SYTL1-201ENST00000318074 TSPY10P0CW01 314 aa28.98■■■□□ 2.23
SYTL1-201ENST00000318074 ABCC1P33527 1531 aa28.97■■■□□ 2.23
SYTL1-201ENST00000318074 ADGRL1O94910 1474 aa28.96■■■□□ 2.23
SYTL1-201ENST00000318074 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.95■■■□□ 2.23
SYTL1-201ENST00000318074 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.95■■■□□ 2.23
SYTL1-201ENST00000318074 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.95■■■□□ 2.22
SYTL1-201ENST00000318074 NEO1Q92859 1461 aa28.95■■■□□ 2.22
SYTL1-201ENST00000318074 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.94■■■□□ 2.22
SYTL1-201ENST00000318074 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
SYTL1-201ENST00000318074 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.93■■■□□ 2.22
SYTL1-201ENST00000318074 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.93■■■□□ 2.22
SYTL1-201ENST00000318074 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.91■■■□□ 2.22
SYTL1-201ENST00000318074 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.88■■■□□ 2.21
SYTL1-201ENST00000318074 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.88■■■□□ 2.21
SYTL1-201ENST00000318074 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.88■■■□□ 2.21
SYTL1-201ENST00000318074 ROCK1Q13464 1354 aa28.88■■■□□ 2.21
SYTL1-201ENST00000318074 AFAP1Q8N556 730 aa28.88■■■□□ 2.21
SYTL1-201ENST00000318074 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.88■■■□□ 2.21
SYTL1-201ENST00000318074 TSPOAP1O95153 1857 aa28.85■■■□□ 2.21
SYTL1-201ENST00000318074 HFM1A2PYH4 1435 aa28.85■■■□□ 2.21
SYTL1-201ENST00000318074 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.85■■■□□ 2.21
SYTL1-201ENST00000318074 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.85■■■□□ 2.21
SYTL1-201ENST00000318074 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.84■■■□□ 2.21
SYTL1-201ENST00000318074 NCOA1Q15788 1441 aa28.82■■■□□ 2.2
SYTL1-201ENST00000318074 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
SYTL1-201ENST00000318074 ADGRL2O95490 1459 aa28.8■■■□□ 2.2
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.8■■■□□ 2.2
SYTL1-201ENST00000318074 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
SYTL1-201ENST00000318074 NAIPQ13075 1403 aa28.8■■■□□ 2.2
SYTL1-201ENST00000318074 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
SYTL1-201ENST00000318074 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.78■■■□□ 2.2
SYTL1-201ENST00000318074 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.78■■■□□ 2.2
SYTL1-201ENST00000318074 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.77■■■□□ 2.2
SYTL1-201ENST00000318074 RAPGEF3O95398 923 aa28.77■■■□□ 2.2
SYTL1-201ENST00000318074 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.76■■■□□ 2.19
SYTL1-201ENST00000318074 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.74■■■□□ 2.19
SYTL1-201ENST00000318074 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.74■■■□□ 2.19
SYTL1-201ENST00000318074 KIF15Q9NS87 1388 aa28.72■■■□□ 2.19
SYTL1-201ENST00000318074 HRCP23327 699 aa28.71■■■□□ 2.19
SYTL1-201ENST00000318074 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.67■■■□□ 2.18
SYTL1-201ENST00000318074 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.67■■■□□ 2.18
SYTL1-201ENST00000318074 KDM5CP41229 1560 aa28.67■■■□□ 2.18
SYTL1-201ENST00000318074 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.66■■■□□ 2.18
SYTL1-201ENST00000318074 ATP7AQ04656 1500 aa28.66■■■□□ 2.18
SYTL1-201ENST00000318074 PLXNC1O60486 1568 aa28.65■■■□□ 2.18
SYTL1-201ENST00000318074 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.64■■■□□ 2.18
SYTL1-201ENST00000318074 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
SYTL1-201ENST00000318074 RICTORQ6R327 1708 aa28.61■■■□□ 2.17
SYTL1-201ENST00000318074 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
SYTL1-201ENST00000318074 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
SYTL1-201ENST00000318074 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.59■■■□□ 2.17
SYTL1-201ENST00000318074 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
SYTL1-201ENST00000318074 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.59■■■□□ 2.17
SYTL1-201ENST00000318074 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.57■■■□□ 2.16
SYTL1-201ENST00000318074 KDM6BO15054 1643 aa28.57■■■□□ 2.16
SYTL1-201ENST00000318074 TRIM52Q96A61 297 aa28.57■■■□□ 2.16
SYTL1-201ENST00000318074 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.56■■■□□ 2.16
SYTL1-201ENST00000318074 ERBINQ96RT1 1412 aa28.53■■■□□ 2.16
SYTL1-201ENST00000318074 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.53■■■□□ 2.16
SYTL1-201ENST00000318074 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.52■■■□□ 2.16
SYTL1-201ENST00000318074 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
SYTL1-201ENST00000318074 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
SYTL1-201ENST00000318074 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.48■■■□□ 2.15
SYTL1-201ENST00000318074 A2MP01023 1474 aa28.48■■■□□ 2.15
SYTL1-201ENST00000318074 ABCA6Q8N139 1617 aa28.45■■■□□ 2.14
SYTL1-201ENST00000318074 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.43■■■□□ 2.14
SYTL1-201ENST00000318074 KIF3BO15066 747 aa28.43■■■□□ 2.14
SYTL1-201ENST00000318074 NUP155O75694 1391 aa28.42■■■□□ 2.14
SYTL1-201ENST00000318074 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.143e-9■■■□□ 16.3
SYTL1-201ENST00000318074 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.39■■■□□ 2.14
SYTL1-201ENST00000318074 ATP10AO60312 1499 aa28.39■■■□□ 2.14
SYTL1-201ENST00000318074 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
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