RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
ZNF554-201ENST00000317243 SYNJ2O15056 1496 aa27.27■■□□□ 1.96
ZNF554-201ENST00000317243 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
ZNF554-201ENST00000317243 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.25■■□□□ 1.95
ZNF554-201ENST00000317243 MIA2Q96PC5 1412 aa27.23■■□□□ 1.95
ZNF554-201ENST00000317243 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.23■■□□□ 1.95
ZNF554-201ENST00000317243 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.23■■□□□ 1.95
ZNF554-201ENST00000317243 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.22■■□□□ 1.95
ZNF554-201ENST00000317243 ABCC5O15440 1437 aa27.21■■□□□ 1.95
ZNF554-201ENST00000317243 DAPK1P53355 1430 aa27.21■■□□□ 1.95
ZNF554-201ENST00000317243 KIF14Q15058 1648 aa27.18■■□□□ 1.94
ZNF554-201ENST00000317243 NEFLP07196 543 aa27.18■■□□□ 1.94
ZNF554-201ENST00000317243 MSH5O43196 834 aa27.17■■□□□ 1.94
ZNF554-201ENST00000317243 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
ZNF554-201ENST00000317243 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
ZNF554-201ENST00000317243 NUP160Q12769 1436 aa27.12■■□□□ 1.93
ZNF554-201ENST00000317243 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
ZNF554-201ENST00000317243 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.1■■□□□ 1.93
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ZNF554-201ENST00000317243 ANP32CO43423 234 aa27.06■■□□□ 1.92
ZNF554-201ENST00000317243 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
ZNF554-201ENST00000317243 AKNAQ7Z591 1439 aa27.06■■□□□ 1.92
ZNF554-201ENST00000317243 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.05■■□□□ 1.92
ZNF554-201ENST00000317243 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
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ZNF554-201ENST00000317243 ATP10BO94823 1461 aa26.98■■□□□ 1.91
ZNF554-201ENST00000317243 ROCK1Q13464 1354 aa26.98■■□□□ 1.91
ZNF554-201ENST00000317243 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.96■■□□□ 1.91
ZNF554-201ENST00000317243 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.96■■□□□ 1.91
ZNF554-201ENST00000317243 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.96■■□□□ 1.91
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ZNF554-201ENST00000317243 NCOA1Q15788 1441 aa26.94■■□□□ 1.9
ZNF554-201ENST00000317243 ABCA8O94911 1581 aa26.92■■□□□ 1.9
ZNF554-201ENST00000317243 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
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ZNF554-201ENST00000317243 PZPP20742 1482 aa26.9■■□□□ 1.9
ZNF554-201ENST00000317243 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.89■■□□□ 1.89
ZNF554-201ENST00000317243 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.88■■□□□ 1.89
ZNF554-201ENST00000317243 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.87■■□□□ 1.89
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ZNF554-201ENST00000317243 PTPRGP23470 1445 aa26.86■■□□□ 1.89
ZNF554-201ENST00000317243 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
ZNF554-201ENST00000317243 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
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ZNF554-201ENST00000317243 CHD1O14646 1710 aa26.85■■□□□ 1.89
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ZNF554-201ENST00000317243 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.84■■□□□ 1.89
ZNF554-201ENST00000317243 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.84■■□□□ 1.89
ZNF554-201ENST00000317243 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.82■■□□□ 1.88
ZNF554-201ENST00000317243 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.8■■□□□ 1.88
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ZNF554-201ENST00000317243 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.75■■□□□ 1.87
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ZNF554-201ENST00000317243 ADGRL2O95490 1459 aa26.73■■□□□ 1.87
ZNF554-201ENST00000317243 NUP155O75694 1391 aa26.73■■□□□ 1.87
ZNF554-201ENST00000317243 TSPY4P0CV99 314 aa26.7■■□□□ 1.87
ZNF554-201ENST00000317243 TSPY10P0CW01 314 aa26.7■■□□□ 1.87
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ZNF554-201ENST00000317243 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.68■■□□□ 1.86
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC7Q96M83 1385 aa26.67■■□□□ 1.86
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ZNF554-201ENST00000317243 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.65■■□□□ 1.86
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ZNF554-201ENST00000317243 MBD5Q9P267 1494 aa26.64■■□□□ 1.86
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ZNF554-201ENST00000317243 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.52■■□□□ 1.84
ZNF554-201ENST00000317243 USP47Q96K76 1375 aa26.52■■□□□ 1.84
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.51■■□□□ 1.83
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ZNF554-201ENST00000317243 MRS2Q9HD23 443 aa26.45■■□□□ 1.82
ZNF554-201ENST00000317243 ABCC2Q92887 1545 aa26.45■■□□□ 1.82
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