RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.52■■■□□ 2.32
PTDSS2-201ENST00000308020 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.5■■■□□ 2.31
PTDSS2-201ENST00000308020 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
PTDSS2-201ENST00000308020 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.49■■■□□ 2.31
PTDSS2-201ENST00000308020 JPH4Q96JJ6 628 aa29.49■■■□□ 2.31
PTDSS2-201ENST00000308020 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.49■■■□□ 2.31
PTDSS2-201ENST00000308020 DAPK1P53355 1430 aa29.48■■■□□ 2.31
PTDSS2-201ENST00000308020 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
PTDSS2-201ENST00000308020 FOXD1Q16676 465 aa29.45■■■□□ 2.3
PTDSS2-201ENST00000308020 ABCC5O15440 1437 aa29.44■■■□□ 2.3
PTDSS2-201ENST00000308020 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.41■■■□□ 2.3
PTDSS2-201ENST00000308020 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
PTDSS2-201ENST00000308020 NUP160Q12769 1436 aa29.4■■■□□ 2.3
PTDSS2-201ENST00000308020 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
PTDSS2-201ENST00000308020 ROCK1Q13464 1354 aa29.39■■■□□ 2.3
PTDSS2-201ENST00000308020 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
PTDSS2-201ENST00000308020 NEFLP07196 543 aa29.35■■■□□ 2.29
PTDSS2-201ENST00000308020 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
PTDSS2-201ENST00000308020 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.31■■■□□ 2.28
PTDSS2-201ENST00000308020 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
PTDSS2-201ENST00000308020 KIF14Q15058 1648 aa29.3■■■□□ 2.28
PTDSS2-201ENST00000308020 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.3■■■□□ 2.28
PTDSS2-201ENST00000308020 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.3■■■□□ 2.28
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
PTDSS2-201ENST00000308020 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.25■■■□□ 2.271e-6■■■■□ 22.5
PTDSS2-201ENST00000308020 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.25■■■□□ 2.27
PTDSS2-201ENST00000308020 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.23■■■□□ 2.27
PTDSS2-201ENST00000308020 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.23■■■□□ 2.27
PTDSS2-201ENST00000308020 NCOA1Q15788 1441 aa29.2■■■□□ 2.26
PTDSS2-201ENST00000308020 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.2■■■□□ 2.26
PTDSS2-201ENST00000308020 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.19■■■□□ 2.26
PTDSS2-201ENST00000308020 ATP10BO94823 1461 aa29.17■■■□□ 2.26
PTDSS2-201ENST00000308020 ABCA8O94911 1581 aa29.17■■■□□ 2.26
PTDSS2-201ENST00000308020 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
PTDSS2-201ENST00000308020 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
PTDSS2-201ENST00000308020 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.1■■■□□ 2.25
PTDSS2-201ENST00000308020 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.1■■■□□ 2.25
PTDSS2-201ENST00000308020 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.1■■■□□ 2.25
PTDSS2-201ENST00000308020 PZPP20742 1482 aa29.09■■■□□ 2.25
PTDSS2-201ENST00000308020 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.09■■■□□ 2.25
PTDSS2-201ENST00000308020 PTPRGP23470 1445 aa29.08■■■□□ 2.25
PTDSS2-201ENST00000308020 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.06■■■□□ 2.24
PTDSS2-201ENST00000308020 ADGRL2O95490 1459 aa29.06■■■□□ 2.24
PTDSS2-201ENST00000308020 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.06■■■□□ 2.24
PTDSS2-201ENST00000308020 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.06■■■□□ 2.24
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC184Q52MB2 194 aa29.06■■■□□ 2.24
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC7Q96M83 1385 aa29.06■■■□□ 2.24
PTDSS2-201ENST00000308020 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.05■■■□□ 2.24
PTDSS2-201ENST00000308020 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.03■■■□□ 2.24
PTDSS2-201ENST00000308020 PKD2Q13563 968 aa29.02■■■□□ 2.24
PTDSS2-201ENST00000308020 TSPY4P0CV99 314 aa29■■■□□ 2.23
PTDSS2-201ENST00000308020 TSPY10P0CW01 314 aa29■■■□□ 2.23
PTDSS2-201ENST00000308020 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.99■■■□□ 2.239e-9■■■■□ 24.5
PTDSS2-201ENST00000308020 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PTDSS2-201ENST00000308020 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.98■■■□□ 2.23
PTDSS2-201ENST00000308020 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
PTDSS2-201ENST00000308020 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.97■■■□□ 2.23
PTDSS2-201ENST00000308020 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
PTDSS2-201ENST00000308020 CHD1O14646 1710 aa28.93■■■□□ 2.22
PTDSS2-201ENST00000308020 NUP155O75694 1391 aa28.93■■■□□ 2.22
PTDSS2-201ENST00000308020 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.93■■■□□ 2.22
PTDSS2-201ENST00000308020 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.93■■■□□ 2.22
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.92■■■□□ 2.22
PTDSS2-201ENST00000308020 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.92■■■□□ 2.22
PTDSS2-201ENST00000308020 MRS2Q9HD23 443 aa28.91■■■□□ 2.22
PTDSS2-201ENST00000308020 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.91■■■□□ 2.22
PTDSS2-201ENST00000308020 KIF15Q9NS87 1388 aa28.86■■■□□ 2.21
PTDSS2-201ENST00000308020 MBD5Q9P267 1494 aa28.84■■■□□ 2.21
PTDSS2-201ENST00000308020 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.8■■■□□ 2.2
PTDSS2-201ENST00000308020 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.79■■■□□ 2.2
PTDSS2-201ENST00000308020 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.79■■■□□ 2.2
PTDSS2-201ENST00000308020 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.77■■■□□ 2.2
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.77■■■□□ 2.2
PTDSS2-201ENST00000308020 SHROOM2Q13796 1616 aa28.76■■■□□ 2.19
PTDSS2-201ENST00000308020 PREX2Q70Z35 1606 aa28.76■■■□□ 2.19
PTDSS2-201ENST00000308020 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
PTDSS2-201ENST00000308020 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.75■■■□□ 2.19
PTDSS2-201ENST00000308020 USP47Q96K76 1375 aa28.74■■■□□ 2.19
PTDSS2-201ENST00000308020 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.73■■■□□ 2.19
PTDSS2-201ENST00000308020 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.73■■■□□ 2.19
PTDSS2-201ENST00000308020 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
PTDSS2-201ENST00000308020 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.71■■■□□ 2.19
PTDSS2-201ENST00000308020 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.71■■■□□ 2.19
PTDSS2-201ENST00000308020 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.7■■■□□ 2.19
PTDSS2-201ENST00000308020 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.7■■■□□ 2.19
PTDSS2-201ENST00000308020 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.69■■■□□ 2.18
PTDSS2-201ENST00000308020 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.69■■■□□ 2.18
PTDSS2-201ENST00000308020 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.182e-7■■■■■ 27.3
PTDSS2-201ENST00000308020 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
PTDSS2-201ENST00000308020 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.67■■■□□ 2.18
PTDSS2-201ENST00000308020 ABCC2Q92887 1545 aa28.67■■■□□ 2.18
PTDSS2-201ENST00000308020 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.66■■■□□ 2.18
PTDSS2-201ENST00000308020 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.65■■■□□ 2.18
PTDSS2-201ENST00000308020 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.64■■■□□ 2.18
PTDSS2-201ENST00000308020 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.63■■■□□ 2.175e-7■■□□□ 12.5
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.62■■■□□ 2.17
PTDSS2-201ENST00000308020 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.62■■■□□ 2.17
PTDSS2-201ENST00000308020 KDM5CP41229 1560 aa28.59■■■□□ 2.17
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