RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 KDM6BO15054 1643 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXD4-201ENST00000306324 NEO1Q92859 1461 aa34.82■■■■□ 3.16
HOXD4-201ENST00000306324 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.81■■■■□ 3.16
HOXD4-201ENST00000306324 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
HOXD4-201ENST00000306324 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.78■■■■□ 3.16
HOXD4-201ENST00000306324 AKNAQ7Z591 1439 aa34.76■■■■□ 3.15
HOXD4-201ENST00000306324 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.75■■■■□ 3.15
HOXD4-201ENST00000306324 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
HOXD4-201ENST00000306324 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
HOXD4-201ENST00000306324 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
HOXD4-201ENST00000306324 ADGRL1O94910 1474 aa34.69■■■■□ 3.14
HOXD4-201ENST00000306324 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.65■■■■□ 3.14
HOXD4-201ENST00000306324 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.63■■■■□ 3.13
HOXD4-201ENST00000306324 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.62■■■■□ 3.13
HOXD4-201ENST00000306324 ABCC1P33527 1531 aa34.6■■■■□ 3.13
HOXD4-201ENST00000306324 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
HOXD4-201ENST00000306324 RICTORQ6R327 1708 aa34.6■■■■□ 3.13
HOXD4-201ENST00000306324 RAPGEF3O95398 923 aa34.58■■■■□ 3.13
HOXD4-201ENST00000306324 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.55■■■■□ 3.12
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
HOXD4-201ENST00000306324 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.55■■■■□ 3.12
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.53■■■■□ 3.12
HOXD4-201ENST00000306324 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.53■■■■□ 3.12
HOXD4-201ENST00000306324 MIA2Q96PC5 1412 aa34.53■■■■□ 3.12
HOXD4-201ENST00000306324 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.52■■■■□ 3.12
HOXD4-201ENST00000306324 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.52■■■■□ 3.12
HOXD4-201ENST00000306324 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.49■■■■□ 3.11
HOXD4-201ENST00000306324 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.48■■■■□ 3.11
HOXD4-201ENST00000306324 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.47■■■■□ 3.11
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.47■■■■□ 3.11
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.47■■■■□ 3.11
HOXD4-201ENST00000306324 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.46■■■■□ 3.11
HOXD4-201ENST00000306324 AFAP1Q8N556 730 aa34.44■■■■□ 3.1
HOXD4-201ENST00000306324 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.41■■■■□ 3.1
HOXD4-201ENST00000306324 KDM5CP41229 1560 aa34.4■■■■□ 3.1
HOXD4-201ENST00000306324 MBD5Q9P267 1494 aa34.39■■■■□ 3.1
HOXD4-201ENST00000306324 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.35■■■■□ 3.09
HOXD4-201ENST00000306324 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
HOXD4-201ENST00000306324 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.34■■■■□ 3.09
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.34■■■■□ 3.09
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.32■■■■□ 3.08
HOXD4-201ENST00000306324 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.31■■■■□ 3.08
HOXD4-201ENST00000306324 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
HOXD4-201ENST00000306324 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.3■■■■□ 3.08
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.28■■■■□ 3.08
HOXD4-201ENST00000306324 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.28■■■■□ 3.08
HOXD4-201ENST00000306324 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.28■■■■□ 3.08
HOXD4-201ENST00000306324 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
HOXD4-201ENST00000306324 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.27■■■■□ 3.08
HOXD4-201ENST00000306324 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.27■■■■□ 3.08
HOXD4-201ENST00000306324 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
HOXD4-201ENST00000306324 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
HOXD4-201ENST00000306324 ATP7AQ04656 1500 aa34.23■■■■□ 3.07
HOXD4-201ENST00000306324 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXD4-201ENST00000306324 ABCA6Q8N139 1617 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXD4-201ENST00000306324 TSPY4P0CV99 314 aa34.21■■■■□ 3.07
HOXD4-201ENST00000306324 TSPY10P0CW01 314 aa34.21■■■■□ 3.07
HOXD4-201ENST00000306324 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.18■■■■□ 3.06
HOXD4-201ENST00000306324 DAPK1P53355 1430 aa34.18■■■■□ 3.06
HOXD4-201ENST00000306324 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
HOXD4-201ENST00000306324 ABCC5O15440 1437 aa34.17■■■■□ 3.06
HOXD4-201ENST00000306324 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.15■■■■□ 3.06
HOXD4-201ENST00000306324 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.14■■■■□ 3.06
HOXD4-201ENST00000306324 ATP10AO60312 1499 aa34.14■■■■□ 3.06
HOXD4-201ENST00000306324 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.13■■■■□ 3.05
HOXD4-201ENST00000306324 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.11■■■■□ 3.05
HOXD4-201ENST00000306324 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.1■■■■□ 3.05
HOXD4-201ENST00000306324 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.1■■■■□ 3.05
HOXD4-201ENST00000306324 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.09■■■■□ 3.05
HOXD4-201ENST00000306324 ITGAEP38570 1179 aa34.06■■■■□ 3.04
HOXD4-201ENST00000306324 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.06■■■■□ 3.04
HOXD4-201ENST00000306324 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
HOXD4-201ENST00000306324 REREQ9P2R6 1566 aa34.04■■■■□ 3.04
HOXD4-201ENST00000306324 PLXNC1O60486 1568 aa34.02■■■■□ 3.04
HOXD4-201ENST00000306324 A2MP01023 1474 aa34.01■■■■□ 3.03
HOXD4-201ENST00000306324 PTPRKQ15262 1439 aa33.98■■■■□ 3.03
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.95■■■■□ 3.03
HOXD4-201ENST00000306324 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.94■■■■□ 3.02
HOXD4-201ENST00000306324 ADGRL2O95490 1459 aa33.93■■■■□ 3.02
HOXD4-201ENST00000306324 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.93■■■■□ 3.02
HOXD4-201ENST00000306324 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
HOXD4-201ENST00000306324 KIF15Q9NS87 1388 aa33.92■■■■□ 3.02
HOXD4-201ENST00000306324 AGLP35573 1532 aa33.92■■■■□ 3.02
HOXD4-201ENST00000306324 NCOA1Q15788 1441 aa33.91■■■■□ 3.02
HOXD4-201ENST00000306324 MLECQ14165 292 aa33.89■■■■□ 3.02
HOXD4-201ENST00000306324 DUOX2Q9NRD8 1548 aa33.89■■■■□ 3.02
HOXD4-201ENST00000306324 ROCK1Q13464 1354 aa33.83■■■■□ 3.01
HOXD4-201ENST00000306324 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.81■■■■□ 3
HOXD4-201ENST00000306324 KIF3BO15066 747 aa33.81■■■■□ 3
HOXD4-201ENST00000306324 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
HOXD4-201ENST00000306324 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa33.78■■■■□ 3
HOXD4-201ENST00000306324 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.78■■■■□ 3
HOXD4-201ENST00000306324 ERBINQ96RT1 1412 aa33.78■■■■□ 3
HOXD4-201ENST00000306324 MADDQ8WXG6 1647 aa33.77■■■■□ 3
HOXD4-201ENST00000306324 GGT6Q6P531 493 aa33.76■■■■□ 3
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.73■■■□□ 2.99
HOXD4-201ENST00000306324 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
HOXD4-201ENST00000306324 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
HOXD4-201ENST00000306324 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.69■■■□□ 2.98
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