RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296504.3

SAP30-201, Transcript of Sin3A associated protein 30, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAP30, Length 1,108 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30-201ENST00000296504 SCAPERQ9BY12 1400 aa45.78■■■■■ 4.92
SAP30-201ENST00000296504 PREX2Q70Z35 1606 aa45.75■■■■■ 4.91
SAP30-201ENST00000296504 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa45.71■■■■■ 4.91
SAP30-201ENST00000296504 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa45.7■■■■■ 4.91
SAP30-201ENST00000296504 POGZQ7Z3K3 1410 aa45.69■■■■■ 4.91
SAP30-201ENST00000296504 MTUS2Q5JR59 1369 aa45.69■■■■■ 4.9
SAP30-201ENST00000296504 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa45.66■■■■■ 4.9
SAP30-201ENST00000296504 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.65■■■■■ 4.9
SAP30-201ENST00000296504 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa45.59■■■■■ 4.89
SAP30-201ENST00000296504 MAGI2Q86UL8 1455 aa45.59■■■■■ 4.89
SAP30-201ENST00000296504 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa45.57■■■■■ 4.89
SAP30-201ENST00000296504 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP45.57■■■■■ 4.88
SAP30-201ENST00000296504 YEATS2Q9ULM3 1422 aa45.54■■■■■ 4.88
SAP30-201ENST00000296504 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa45.53■■■■■ 4.88
SAP30-201ENST00000296504 ABCC1P33527 1531 aa45.52■■■■■ 4.88
SAP30-201ENST00000296504 TIAM1Q13009 1591 aa45.5■■■■■ 4.87
SAP30-201ENST00000296504 CCNB3Q8WWL7 1395 aa45.49■■■■■ 4.87
SAP30-201ENST00000296504 ITSN2Q9NZM3 1697 aa45.47■■■■■ 4.87
SAP30-201ENST00000296504 KDM5CP41229 1560 aa45.47■■■■■ 4.87
SAP30-201ENST00000296504 AFAP1Q8N556 730 aa45.47■■■■■ 4.87
SAP30-201ENST00000296504 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa45.47■■■■■ 4.87
SAP30-201ENST00000296504 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP45.46■■■■■ 4.87
SAP30-201ENST00000296504 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP45.44■■■■■ 4.86
SAP30-201ENST00000296504 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa45.43■■■■■ 4.86
SAP30-201ENST00000296504 BCORL1Q5H9F3 1711 aa45.41■■■■■ 4.86
SAP30-201ENST00000296504 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP45.4■■■■■ 4.86
SAP30-201ENST00000296504 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa45.4■■■■■ 4.86
SAP30-201ENST00000296504 ADAMTSL3P82987 1691 aa45.4■■■■■ 4.86
SAP30-201ENST00000296504 HECW2Q9P2P5 1572 aa45.37■■■■■ 4.85
SAP30-201ENST00000296504 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP45.36■■■■■ 4.85
SAP30-201ENST00000296504 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa45.36■■■■■ 4.85
SAP30-201ENST00000296504 ATP10AO60312 1499 aa45.34■■■■■ 4.85
SAP30-201ENST00000296504 SYCP2Q9BX26 1530 aa45.31■■■■■ 4.84
SAP30-201ENST00000296504 MYT1LQ9UL68 1186 aa45.31■■■■■ 4.84
SAP30-201ENST00000296504 MAP3K1Q13233 1512 aa45.31■■■■■ 4.84
SAP30-201ENST00000296504 NCOA2Q15596 1464 aa45.3■■■■■ 4.84
SAP30-201ENST00000296504 MLH3Q9UHC1 1453 aa45.3■■■■■ 4.84
SAP30-201ENST00000296504 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa45.29■■■■■ 4.84
SAP30-201ENST00000296504 C9orf84Q5VXU9 1444 aa45.28■■■■■ 4.84
SAP30-201ENST00000296504 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa45.28■■■■■ 4.84
SAP30-201ENST00000296504 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa45.26■■■■■ 4.84
SAP30-201ENST00000296504 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP45.25■■■■■ 4.83
SAP30-201ENST00000296504 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa45.24■■■■■ 4.83
SAP30-201ENST00000296504 MADDQ8WXG6 1647 aa45.24■■■■■ 4.83
SAP30-201ENST00000296504 ABCA6Q8N139 1617 aa45.22■■■■■ 4.83
SAP30-201ENST00000296504 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa45.2■■■■■ 4.83
SAP30-201ENST00000296504 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP45.18■■■■■ 4.82
SAP30-201ENST00000296504 PTPRMP28827 1452 aa45.17■■■■■ 4.82
SAP30-201ENST00000296504 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP45.17■■■■■ 4.82
SAP30-201ENST00000296504 REREQ9P2R6 1566 aa45.13■■■■■ 4.82
SAP30-201ENST00000296504 MLECQ14165 292 aa45.12■■■■■ 4.81
SAP30-201ENST00000296504 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP45.12■■■■■ 4.81
SAP30-201ENST00000296504 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP45.1■■■■■ 4.81
SAP30-201ENST00000296504 APLP2Q06481 763 aa45.08■■■■■ 4.81
SAP30-201ENST00000296504 MBD5Q9P267 1494 aa45.05■■■■■ 4.8
SAP30-201ENST00000296504 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa45.03■■■■■ 4.8
SAP30-201ENST00000296504 ATP7AQ04656 1500 aa45.03■■■■■ 4.8
SAP30-201ENST00000296504 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP45.03■■■■■ 4.8
SAP30-201ENST00000296504 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa45.02■■■■■ 4.8
SAP30-201ENST00000296504 AGLP35573 1532 aa44.98■■■■■ 4.79
SAP30-201ENST00000296504 MYOM3Q5VTT5 1437 aa44.9■■■■■ 4.78
SAP30-201ENST00000296504 CCDC141Q6ZP82 1450 aa44.89■■■■■ 4.78
SAP30-201ENST00000296504 RSPH4AQ5TD94 716 aa44.85■■■■■ 4.77
SAP30-201ENST00000296504 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa44.84■■■■■ 4.77
SAP30-201ENST00000296504 MIA2Q96PC5 1412 aa44.84■■■■■ 4.77
SAP30-201ENST00000296504 ARHGEF5Q12774 1597 aa44.84■■■■■ 4.77
SAP30-201ENST00000296504 PLPPR3Q6T4P5 718 aa44.82■■■■■ 4.77
SAP30-201ENST00000296504 A2MP01023 1474 aa44.82■■■■■ 4.77
SAP30-201ENST00000296504 ADGBQ8N7X0 1667 aa44.82■■■■■ 4.77
SAP30-201ENST00000296504 PLXNC1O60486 1568 aa44.8■■■■■ 4.76
SAP30-201ENST00000296504 TSPY4P0CV99 314 aa44.68■■■■■ 4.74
SAP30-201ENST00000296504 TSPY10P0CW01 314 aa44.68■■■■■ 4.74
SAP30-201ENST00000296504 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
SAP30-201ENST00000296504 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP44.67■■■■■ 4.74
SAP30-201ENST00000296504 PTPN23Q9H3S7 1636 aa44.64■■■■■ 4.74
SAP30-201ENST00000296504 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.73
SAP30-201ENST00000296504 LMTK3Q96Q04 1460 aa44.62■■■■■ 4.73
SAP30-201ENST00000296504 MAST1Q9Y2H9 1570 aa44.6■■■■■ 4.73
SAP30-201ENST00000296504 CNTLNQ9NXG0 1405 aa44.6■■■■■ 4.73
SAP30-201ENST00000296504 C3P01024 1663 aa44.6■■■■■ 4.73
SAP30-201ENST00000296504 FGD6Q6ZV73 1430 aa44.59■■■■■ 4.73
SAP30-201ENST00000296504 GGT6Q6P531 493 aa44.55■■■■■ 4.72
SAP30-201ENST00000296504 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP44.53■■■■■ 4.72
SAP30-201ENST00000296504 MROH2AA6NES4 1674 aa44.52■■■■■ 4.72
SAP30-201ENST00000296504 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
SAP30-201ENST00000296504 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
SAP30-201ENST00000296504 PREX1Q8TCU6 1659 aa44.48■■■■■ 4.71
SAP30-201ENST00000296504 CROCC2H7BZ55 1655 aa44.47■■■■■ 4.71
SAP30-201ENST00000296504 ABCC5O15440 1437 aa44.45■■■■■ 4.71
SAP30-201ENST00000296504 KIF3BO15066 747 aa44.45■■■■■ 4.71
SAP30-201ENST00000296504 PPP6R1Q9UPN7 881 aa44.44■■■■■ 4.7
SAP30-201ENST00000296504 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP44.42■■■■■ 4.7
SAP30-201ENST00000296504 ZMYM3Q14202 1370 aa44.42■■■■■ 4.7
SAP30-201ENST00000296504 SHANK2Q9UPX8 1470 aa44.41■■■■■ 4.7
SAP30-201ENST00000296504 HSPA2P54652 639 aa44.4■■■■■ 4.7
SAP30-201ENST00000296504 DAPK1P53355 1430 aa44.4■■■■■ 4.7
SAP30-201ENST00000296504 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa44.33■■■■■ 4.69
SAP30-201ENST00000296504 DUOX2Q9NRD8 1548 aa44.29■■■■■ 4.68
SAP30-201ENST00000296504 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
SAP30-201ENST00000296504 NPATQ14207 1427 aa44.29■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms