RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296504.3

SAP30-201, Transcript of Sin3A associated protein 30, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAP30, Length 1,108 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30-201ENST00000296504 JPH4Q96JJ6 628 aa48.75■■■■■ 5.39
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SAP30-201ENST00000296504 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.54■■■■■ 5.36
SAP30-201ENST00000296504 IQGAP2Q13576 1575 aa48.37■■■■■ 5.33
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SAP30-201ENST00000296504 ABCA8O94911 1581 aa47.43■■■■■ 5.18
SAP30-201ENST00000296504 ASXL2Q76L83 1435 aa47.42■■■■■ 5.18
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SAP30-201ENST00000296504 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.18■■■■■ 5.14
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SAP30-201ENST00000296504 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
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SAP30-201ENST00000296504 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.11■■■■■ 5.13
SAP30-201ENST00000296504 ATP10BO94823 1461 aa47.03■■■■■ 5.12
SAP30-201ENST00000296504 ARID3CA6NKF2 412 aa47.02■■■■■ 5.12
SAP30-201ENST00000296504 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP46.98■■■■■ 5.11
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SAP30-201ENST00000296504 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.89■■■■■ 5.1
SAP30-201ENST00000296504 KDM6BO15054 1643 aa46.89■■■■■ 5.1
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SAP30-201ENST00000296504 CD109Q6YHK3 1445 aa46.72■■■■■ 5.07
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SAP30-201ENST00000296504 ABCA9Q8IUA7 1624 aa46.61■■■■■ 5.05
SAP30-201ENST00000296504 HECW1Q76N89 1606 aa46.58■■■■■ 5.05
SAP30-201ENST00000296504 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.58■■■■■ 5.05
SAP30-201ENST00000296504 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
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SAP30-201ENST00000296504 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP46.54■■■■■ 5.04
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SAP30-201ENST00000296504 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa46.37■■■■■ 5.01
SAP30-201ENST00000296504 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP46.35■■■■■ 5.01
SAP30-201ENST00000296504 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.34■■■■■ 5.01
SAP30-201ENST00000296504 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP46.33■■■■■ 5.015e-7■■□□□ 12.4
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SAP30-201ENST00000296504 ARAP3Q8WWN8 1544 aa46.27■■■■■ 5
SAP30-201ENST00000296504 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.26■■■■■ 5
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SAP30-201ENST00000296504 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.19■■■■■ 4.99
SAP30-201ENST00000296504 CEP162Q5TB80 1403 aa46.18■■■■■ 4.98
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SAP30-201ENST00000296504 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa46.1■■■■■ 4.97
SAP30-201ENST00000296504 FANCAO15360 1455 aa46.09■■■■■ 4.97
SAP30-201ENST00000296504 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.09■■■■■ 4.97
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SAP30-201ENST00000296504 AKNAQ7Z591 1439 aa46.03■■■■■ 4.96
SAP30-201ENST00000296504 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.03■■■■■ 4.96
SAP30-201ENST00000296504 RAPGEF3O95398 923 aa46.01■■■■■ 4.96
SAP30-201ENST00000296504 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa45.96■■■■■ 4.95
SAP30-201ENST00000296504 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP45.93■■■■■ 4.94
SAP30-201ENST00000296504 RICTORQ6R327 1708 aa45.89■■■■■ 4.94
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SAP30-201ENST00000296504 ADGRL1O94910 1474 aa45.86■■■■■ 4.93
SAP30-201ENST00000296504 ARHGAP5Q13017 1502 aa45.81■■■■■ 4.92
SAP30-201ENST00000296504 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa45.79■■■■■ 4.92
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