RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.33■□□□□ 0.85
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USP43-201ENST00000285199 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.23■□□□□ 0.83
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USP43-201ENST00000285199 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
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USP43-201ENST00000285199 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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USP43-201ENST00000285199 SYNJ1O43426 1573 aa20.07■□□□□ 0.8
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USP43-201ENST00000285199 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
USP43-201ENST00000285199 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
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USP43-201ENST00000285199 C20orf194Q5TEA3 1177 aa19.91■□□□□ 0.78
USP43-201ENST00000285199 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.91■□□□□ 0.78
USP43-201ENST00000285199 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
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USP43-201ENST00000285199 STK26Q9P289 416 aa19.89■□□□□ 0.78
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USP43-201ENST00000285199 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
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