RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262197.7

RBFA-201, Transcript of ribosome binding factor A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RBFA, Length 1,219 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFA-201ENST00000262197 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.31■■■■□ 3.56
RBFA-201ENST00000262197 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.3■■■■□ 3.56
RBFA-201ENST00000262197 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.29■■■■□ 3.56
RBFA-201ENST00000262197 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.28■■■■□ 3.56
RBFA-201ENST00000262197 KDM6BO15054 1643 aa37.26■■■■□ 3.56
RBFA-201ENST00000262197 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
RBFA-201ENST00000262197 AKNAQ7Z591 1439 aa37.2■■■■□ 3.55
RBFA-201ENST00000262197 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
RBFA-201ENST00000262197 ADGRL1O94910 1474 aa37.13■■■■□ 3.53
RBFA-201ENST00000262197 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
RBFA-201ENST00000262197 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.07■■■■□ 3.52
RBFA-201ENST00000262197 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
RBFA-201ENST00000262197 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.05■■■■□ 3.52
RBFA-201ENST00000262197 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
RBFA-201ENST00000262197 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.04■■■■□ 3.52
RBFA-201ENST00000262197 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.04■■■■□ 3.52
RBFA-201ENST00000262197 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
RBFA-201ENST00000262197 ABCC1P33527 1531 aa37.02■■■■□ 3.52
RBFA-201ENST00000262197 MIA2Q96PC5 1412 aa37.01■■■■□ 3.51
RBFA-201ENST00000262197 RICTORQ6R327 1708 aa36.99■■■■□ 3.51
RBFA-201ENST00000262197 RAPGEF3O95398 923 aa36.96■■■■□ 3.51
RBFA-201ENST00000262197 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.94■■■■□ 3.5
RBFA-201ENST00000262197 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.94■■■■□ 3.5
RBFA-201ENST00000262197 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.94■■■■□ 3.5
RBFA-201ENST00000262197 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.93■■■■□ 3.5
RBFA-201ENST00000262197 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.93■■■■□ 3.5
RBFA-201ENST00000262197 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.91■■■■□ 3.5
RBFA-201ENST00000262197 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
RBFA-201ENST00000262197 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.9■■■■□ 3.5
RBFA-201ENST00000262197 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.88■■■■□ 3.5
RBFA-201ENST00000262197 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.88■■■■□ 3.49
RBFA-201ENST00000262197 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.87■■■■□ 3.491e-8■■■■■ 31.3
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RBFA-201ENST00000262197 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.83■■■■□ 3.49
RBFA-201ENST00000262197 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.82■■■■□ 3.48
RBFA-201ENST00000262197 AFAP1Q8N556 730 aa36.82■■■■□ 3.48
RBFA-201ENST00000262197 KDM5CP41229 1560 aa36.81■■■■□ 3.48
RBFA-201ENST00000262197 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.8■■■■□ 3.48
RBFA-201ENST00000262197 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.79■■■■□ 3.48
RBFA-201ENST00000262197 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.78■■■■□ 3.48
RBFA-201ENST00000262197 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
RBFA-201ENST00000262197 MBD5Q9P267 1494 aa36.77■■■■□ 3.48
RBFA-201ENST00000262197 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.76■■■■□ 3.48
RBFA-201ENST00000262197 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.75■■■■□ 3.47
RBFA-201ENST00000262197 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
RBFA-201ENST00000262197 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.73■■■■□ 3.47
RBFA-201ENST00000262197 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
RBFA-201ENST00000262197 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.7■■■■□ 3.47
RBFA-201ENST00000262197 TSPY4P0CV99 314 aa36.69■■■■□ 3.46
RBFA-201ENST00000262197 TSPY10P0CW01 314 aa36.69■■■■□ 3.46
RBFA-201ENST00000262197 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.69■■■■□ 3.46
RBFA-201ENST00000262197 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.64■■■■□ 3.46
RBFA-201ENST00000262197 ATP7AQ04656 1500 aa36.64■■■■□ 3.46
RBFA-201ENST00000262197 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
RBFA-201ENST00000262197 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
RBFA-201ENST00000262197 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.61■■■■□ 3.45
RBFA-201ENST00000262197 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.61■■■■□ 3.45
RBFA-201ENST00000262197 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.59■■■■□ 3.45
RBFA-201ENST00000262197 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
RBFA-201ENST00000262197 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.59■■■■□ 3.45
RBFA-201ENST00000262197 DAPK1P53355 1430 aa36.58■■■■□ 3.45
RBFA-201ENST00000262197 ATP10AO60312 1499 aa36.56■■■■□ 3.44
RBFA-201ENST00000262197 ABCA6Q8N139 1617 aa36.56■■■■□ 3.44
RBFA-201ENST00000262197 ABCC5O15440 1437 aa36.56■■■■□ 3.44
RBFA-201ENST00000262197 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.56■■■■□ 3.44
RBFA-201ENST00000262197 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.56■■■■□ 3.44
RBFA-201ENST00000262197 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.54■■■■□ 3.44
RBFA-201ENST00000262197 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.54■■■■□ 3.44
RBFA-201ENST00000262197 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.51■■■■□ 3.44
RBFA-201ENST00000262197 REREQ9P2R6 1566 aa36.46■■■■□ 3.43
RBFA-201ENST00000262197 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
RBFA-201ENST00000262197 PLXNC1O60486 1568 aa36.43■■■■□ 3.42
RBFA-201ENST00000262197 ITGAEP38570 1179 aa36.41■■■■□ 3.42
RBFA-201ENST00000262197 A2MP01023 1474 aa36.41■■■■□ 3.42
RBFA-201ENST00000262197 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.4■■■■□ 3.42
RBFA-201ENST00000262197 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.4■■■■□ 3.42
RBFA-201ENST00000262197 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.34■■■■□ 3.41
RBFA-201ENST00000262197 ADGRL2O95490 1459 aa36.33■■■■□ 3.41
RBFA-201ENST00000262197 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
RBFA-201ENST00000262197 AGLP35573 1532 aa36.33■■■■□ 3.41
RBFA-201ENST00000262197 KIF15Q9NS87 1388 aa36.31■■■■□ 3.4
RBFA-201ENST00000262197 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.31■■■■□ 3.4
RBFA-201ENST00000262197 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.3■■■■□ 3.4
RBFA-201ENST00000262197 NCOA1Q15788 1441 aa36.3■■■■□ 3.4
RBFA-201ENST00000262197 PTPRKQ15262 1439 aa36.29■■■■□ 3.4
RBFA-201ENST00000262197 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.28■■■■□ 3.4
RBFA-201ENST00000262197 ROCK1Q13464 1354 aa36.27■■■■□ 3.4
RBFA-201ENST00000262197 MLECQ14165 292 aa36.23■■■■□ 3.39
RBFA-201ENST00000262197 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
RBFA-201ENST00000262197 ERBINQ96RT1 1412 aa36.19■■■■□ 3.38
RBFA-201ENST00000262197 KIF3BO15066 747 aa36.18■■■■□ 3.38
RBFA-201ENST00000262197 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.16■■■■□ 3.38
RBFA-201ENST00000262197 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.14■■■■□ 3.38
RBFA-201ENST00000262197 GGT6Q6P531 493 aa36.12■■■■□ 3.37
RBFA-201ENST00000262197 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
RBFA-201ENST00000262197 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.1■■■■□ 3.37
RBFA-201ENST00000262197 MADDQ8WXG6 1647 aa36.09■■■■□ 3.37
RBFA-201ENST00000262197 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.08■■■■□ 3.37
RBFA-201ENST00000262197 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
RBFA-201ENST00000262197 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.07■■■■□ 3.36
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