RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 KIF3BO15066 747 aa7.19□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 TAOK2Q9UL54 1235 aa7.19□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.19□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 CCER2I3L3R5 266 aa7.18□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 JPH4Q96JJ6 628 aa7.18□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 NUTM2FA1L443 756 aa7.18□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.18□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa7.18□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 MORC1Q86VD1 984 aa7.18□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 APBB1O00213 710 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 TRHP20396 242 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 NUDCQ9Y266 331 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 RCAN3Q9UKA8 241 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 PLIN1O60240 522 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 FMN1Q68DA7 1419 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 BECN1Q14457 450 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 IGF1RP08069 1367 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 PANK3Q9H999 370 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 KANK1Q14678 1352 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 SLC4A3P48751 1232 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 PLCB2Q00722 1185 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-201ENST00000261169 PHLDB1Q86UU1 1377 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 NLRP13Q86W25 1043 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 CFTRP13569 1480 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 DEKP35659 375 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 RALBP1Q15311 655 aa7.07□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.07□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 ITPRIPQ8IWB1 547 aa7.07□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 EXOC6Q8TAG9 804 aa7.07□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.07□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 GOLGA2Q08379 1002 aa7.06□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 APAF1O14727 1248 aa7.06□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 GOLGA6L22H0YM25 854 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 SMC4Q9NTJ3 1288 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 KCNJ4P48050 445 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 FOXD4L1Q9NU39 408 aa7.04□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 SLC4A10Q6U841 1118 aa7.04□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.04□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 USP47Q96K76 1375 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 PTMAP06454 111 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 CCDC18Q5T9S5 1454 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 FGD1P98174 961 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 CCDC184Q52MB2 194 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 AFAP1Q8N556 730 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 COG6Q9Y2V7 657 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 KIF7Q2M1P5 1343 aa7.02□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 WASHC2AQ641Q2 1341 aa7.02□□□□□ -1.28
LMO3-201ENST00000261169 PTPRGP23470 1445 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-201ENST00000261169 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-201ENST00000261169 CASC1Q6TDU7 716 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-201ENST00000261169 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
LMO3-201ENST00000261169 CRBNQ96SW2 442 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-201ENST00000261169 ARAP1Q96P48 1450 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-201ENST00000261169 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-201ENST00000261169 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
LMO3-201ENST00000261169 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.01□□□□□ -1.29
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