RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 DIP2BQ9P265 1576 aa28.31■■■□□ 2.12
PRRT1-201ENST00000211413 PREX2Q70Z35 1606 aa28.3■■■□□ 2.12
PRRT1-201ENST00000211413 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.29■■■□□ 2.12
PRRT1-201ENST00000211413 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.29■■■□□ 2.12
PRRT1-201ENST00000211413 CD109Q6YHK3 1445 aa28.28■■■□□ 2.12
PRRT1-201ENST00000211413 PLCH2O75038 1416 aa28.27■■■□□ 2.12
PRRT1-201ENST00000211413 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.26■■■□□ 2.11
PRRT1-201ENST00000211413 TSPOAP1O95153 1857 aa28.25■■■□□ 2.11
PRRT1-201ENST00000211413 MIA2Q96PC5 1412 aa28.25■■■□□ 2.11
PRRT1-201ENST00000211413 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.23■■■□□ 2.11
PRRT1-201ENST00000211413 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
PRRT1-201ENST00000211413 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
PRRT1-201ENST00000211413 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.21■■■□□ 2.11
PRRT1-201ENST00000211413 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.19■■■□□ 2.1
PRRT1-201ENST00000211413 GLI2P10070 1586 aa28.19■■■□□ 2.1
PRRT1-201ENST00000211413 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
PRRT1-201ENST00000211413 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.19■■■□□ 2.1
PRRT1-201ENST00000211413 FANCAO15360 1455 aa28.17■■■□□ 2.1
PRRT1-201ENST00000211413 PTPRKQ15262 1439 aa28.16■■■□□ 2.1
PRRT1-201ENST00000211413 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.15■■■□□ 2.1
PRRT1-201ENST00000211413 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.13■■■□□ 2.09
PRRT1-201ENST00000211413 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.11■■■□□ 2.09
PRRT1-201ENST00000211413 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
PRRT1-201ENST00000211413 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.09
PRRT1-201ENST00000211413 ABCC5O15440 1437 aa28.08■■■□□ 2.09
PRRT1-201ENST00000211413 AKNAQ7Z591 1439 aa28.08■■■□□ 2.09
PRRT1-201ENST00000211413 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.08■■■□□ 2.08
PRRT1-201ENST00000211413 MBD5Q9P267 1494 aa28.07■■■□□ 2.08
PRRT1-201ENST00000211413 DAPK1P53355 1430 aa28.05■■■□□ 2.08
PRRT1-201ENST00000211413 AFAP1Q8N556 730 aa28.05■■■□□ 2.08
PRRT1-201ENST00000211413 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.04■■■□□ 2.08
PRRT1-201ENST00000211413 ADGRL1O94910 1474 aa28.04■■■□□ 2.08
PRRT1-201ENST00000211413 ABCC1P33527 1531 aa28.04■■■□□ 2.08
PRRT1-201ENST00000211413 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.04■■■□□ 2.08
PRRT1-201ENST00000211413 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
PRRT1-201ENST00000211413 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28■■■□□ 2.07
PRRT1-201ENST00000211413 RAPGEF3O95398 923 aa27.99■■■□□ 2.07
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.97■■■□□ 2.07
PRRT1-201ENST00000211413 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.95■■■□□ 2.07
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.95■■■□□ 2.06
PRRT1-201ENST00000211413 NEO1Q92859 1461 aa27.95■■■□□ 2.06
PRRT1-201ENST00000211413 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.94■■■□□ 2.06
PRRT1-201ENST00000211413 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.94■■■□□ 2.06
PRRT1-201ENST00000211413 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.93■■■□□ 2.06
PRRT1-201ENST00000211413 TSPY4P0CV99 314 aa27.93■■■□□ 2.06
PRRT1-201ENST00000211413 TSPY10P0CW01 314 aa27.93■■■□□ 2.06
PRRT1-201ENST00000211413 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.9■■■□□ 2.06
PRRT1-201ENST00000211413 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.9■■■□□ 2.06
PRRT1-201ENST00000211413 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
PRRT1-201ENST00000211413 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.89■■■□□ 2.06
PRRT1-201ENST00000211413 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.86■■■□□ 2.05
PRRT1-201ENST00000211413 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
PRRT1-201ENST00000211413 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
PRRT1-201ENST00000211413 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.85■■■□□ 2.05
PRRT1-201ENST00000211413 NCOA1Q15788 1441 aa27.83■■■□□ 2.05
PRRT1-201ENST00000211413 NAIPQ13075 1403 aa27.82■■■□□ 2.04
PRRT1-201ENST00000211413 KDM6BO15054 1643 aa27.81■■■□□ 2.04
PRRT1-201ENST00000211413 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
PRRT1-201ENST00000211413 RICTORQ6R327 1708 aa27.81■■■□□ 2.04
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.8■■■□□ 2.04
PRRT1-201ENST00000211413 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.8■■■□□ 2.04
PRRT1-201ENST00000211413 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.8■■■□□ 2.04
PRRT1-201ENST00000211413 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.8■■■□□ 2.04
PRRT1-201ENST00000211413 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.78■■■□□ 2.04
PRRT1-201ENST00000211413 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.78■■■□□ 2.04
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.78■■■□□ 2.04
PRRT1-201ENST00000211413 HFM1A2PYH4 1435 aa27.77■■■□□ 2.04
PRRT1-201ENST00000211413 ROCK1Q13464 1354 aa27.77■■■□□ 2.04
PRRT1-201ENST00000211413 ADGRL2O95490 1459 aa27.76■■■□□ 2.03
PRRT1-201ENST00000211413 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.76■■■□□ 2.03
PRRT1-201ENST00000211413 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.75■■■□□ 2.03
PRRT1-201ENST00000211413 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.75■■■□□ 2.03
PRRT1-201ENST00000211413 KIF15Q9NS87 1388 aa27.75■■■□□ 2.03
PRRT1-201ENST00000211413 ATP7AQ04656 1500 aa27.74■■■□□ 2.03
PRRT1-201ENST00000211413 KDM5CP41229 1560 aa27.74■■■□□ 2.03
PRRT1-201ENST00000211413 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
PRRT1-201ENST00000211413 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.71■■■□□ 2.03
PRRT1-201ENST00000211413 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.7■■■□□ 2.03
PRRT1-201ENST00000211413 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.68■■■□□ 2.02
PRRT1-201ENST00000211413 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.68■■■□□ 2.02
PRRT1-201ENST00000211413 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.66■■■□□ 2.02
PRRT1-201ENST00000211413 PLXNC1O60486 1568 aa27.66■■■□□ 2.02
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.65■■■□□ 2.02
PRRT1-201ENST00000211413 ABCA6Q8N139 1617 aa27.65■■■□□ 2.02
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM52Q96A61 297 aa27.61■■■□□ 2.01
PRRT1-201ENST00000211413 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.59■■■□□ 2.01
PRRT1-201ENST00000211413 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.59■■■□□ 2.01
PRRT1-201ENST00000211413 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.58■■■□□ 2.01
PRRT1-201ENST00000211413 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
PRRT1-201ENST00000211413 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
PRRT1-201ENST00000211413 A2MP01023 1474 aa27.54■■■□□ 2
PRRT1-201ENST00000211413 KIF3BO15066 747 aa27.54■■■□□ 2
PRRT1-201ENST00000211413 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.51■■□□□ 1.99
PRRT1-201ENST00000211413 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
PRRT1-201ENST00000211413 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.49■■□□□ 1.99
PRRT1-201ENST00000211413 ERBINQ96RT1 1412 aa27.49■■□□□ 1.99
PRRT1-201ENST00000211413 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
PRRT1-201ENST00000211413 ATP10AO60312 1499 aa27.47■■□□□ 1.99
PRRT1-201ENST00000211413 GGT6Q6P531 493 aa27.46■■□□□ 1.99
PRRT1-201ENST00000211413 FOXD1Q16676 465 aa27.45■■□□□ 1.99
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