RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000051454.3

Fam171b-201, Transcript of Protein FAM171B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Fam171b, Length 5,614 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Neurod2Q62414 383 aa22.12■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Shroom4Q1W617 1475 aa22.11■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 UacaQ8CGB3 1411 aa22.11■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rad54l2Q99NG0 1466 aa22.09■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Duox2A2AQ99 1517 aa22.08■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Stard8Q8K031 1019 aa22.08■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa22.08■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gm6268A2A3U9 297 aa22.08■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Tmf1B9EKI3 1091 aa22.08■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Frmpd1A2AKB4 1549 aa22.07■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ap3b2Q9JME5 1082 aa22.05■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Srcin1Q9QWI6 1250 aa22.04■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Znf316Q6PGE4 1016 aa22.03■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Tdrd9Q14BI7 1383 aa22.03■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rock2P70336 1388 aa22.02■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Myt1Q8CFC2 1127 aa22.02■■□□□ 1.11
Fam171b-201ENSMUST00000051454 CenpjQ569L8 1344 aa22.01■■□□□ 1.11
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Birc3O08863 600 aa22.01■■□□□ 1.11
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Znf326O88291 580 aa22■■□□□ 1.11
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa21.99■■□□□ 1.11
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Fan1Q69ZT1 1020 aa21.99■■□□□ 1.11
Fam171b-201ENSMUST00000051454 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ift140E9PY46 1464 aa21.97■■□□□ 1.11
Fam171b-201ENSMUST00000051454 DaxxO35613 739 aa21.96■■□□□ 1.11
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 CadpsQ80TJ1 1355 aa21.95■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Apbb1Q9QXJ1 710 aa21.94■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 NrkQ9R0G8 1455 aa21.93■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Shq1Q7TMX5 569 aa21.92■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Q8BT18 775 aa21.92■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Dcaf11Q91VU6 549 aa21.92■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Plin1Q8CGN5 517 aa21.91■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Anks4bQ8K3X6 423 aa21.91■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gm14025A2AP89 1413 aa21.9■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Prdm16A2A935 1275 aa21.9■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cux1P53564 1515 aa21.87■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa21.87■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Grin2bQ01097 1482 aa21.86■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa21.86■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Bcl11bQ99PV8 884 aa21.86■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Plb1Q3TTY0 1478 aa21.85■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Nsd2Q8BVE8 1365 aa21.85■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 ErbinQ80TH2 1402 aa21.83■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa21.83■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Wdr62Q3U3T8 1523 aa21.83■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 BicraF8VPZ9 1578 aa21.82■■□□□ 1.08
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Pak3Q61036 559 aa21.81■■□□□ 1.08
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa21.81■■□□□ 1.08
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Pip4k2bQ80XI4 416 aa21.81■■□□□ 1.08
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Arhgap5P97393 1501 aa21.8■■□□□ 1.08
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Q3TQI7 289 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Trim30dE9PWL0 497 aa21.79■■□□□ 1.08
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Slc4a1apE9PX68 744 aa21.77■■□□□ 1.08
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Usp40Q8BWR4 1235 aa21.76■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cabp4Q8VHC5 271 aa21.76■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Usp47Q8BY87 1376 aa21.75■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa21.75■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Golga2Q921M4 999 aa21.73■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa21.73■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Zscan21Q07231 555 aa21.73■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Pde4cQ3UEI1 686 aa21.73■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Atf3Q60765 181 aa21.71■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Mink1Q9JM52 1308 aa21.71■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Tnnt1O88346 262 aa21.7■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Map7O88735 730 aa21.7■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rwdd1Q9CQK7 243 aa21.69■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Crocc2F6XLV1 1638 aa21.69■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Fyb1O35601 819 aa21.68■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ecm2Q5FW85 670 aa21.67■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Igf1rQ60751 1373 aa21.67■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Map3k5O35099 1380 aa21.67■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Map3k1P53349 1493 aa21.66■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gm38655A0A286YDK6 273 aa21.66■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Fam163aQ8CAA5 168 aa21.66■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa21.65■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Exoc6Q8R313 802 aa21.64■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa21.63■■□□□ 1.05
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Clstn1Q9EPL2 979 aa21.63■■□□□ 1.05
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cyb5rlB1AS42 316 aa21.62■■□□□ 1.05
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Stk31Q99MW1 1018 aa21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.2 ms