RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trak1Q6PD31 939 aa21.79■■□□□ 1.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NexmifQ5DTT1 1515 aa21.77■■□□□ 1.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mtus2Q3UHD3 1353 aa21.77■■□□□ 1.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rundc1Q0VDN7 615 aa21.76■■□□□ 1.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Amer1Q7TS75 1132 aa21.75■■□□□ 1.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BC005561E9Q5E2 1589 aa21.73■■□□□ 1.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Crocc2F6XLV1 1638 aa21.73■■□□□ 1.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa21.71■■□□□ 1.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ofd1Q80Z25 1017 aa21.71■■□□□ 1.07
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ift140E9PY46 1464 aa21.69■■□□□ 1.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm13695A2AK44 830 aa21.68■■□□□ 1.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4933416C03RikQ3V063 378 aa21.68■■□□□ 1.06
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dapk1Q80YE7 1442 aa21.57■■□□□ 1.04
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa21.57■■□□□ 1.04
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Camsap2Q8C1B1 1461 aa21.52■■□□□ 1.04
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Disp1Q3TDN0 1521 aa21.5■■□□□ 1.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa21.49■■□□□ 1.03
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 L3mbtl2P59178 703 aa21.47■■□□□ 1.03
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa21.46■■□□□ 1.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa21.45■■□□□ 1.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrc2Q64449 1479 aa21.45■■□□□ 1.02
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abca5Q8K448 1642 aa21.44■■□□□ 1.02
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa21.42■■□□□ 1.02
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ipo9Q91YE6 1041 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q7TT23 1179 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Os9Q8K2C7 672 aa21.37■■□□□ 1.01
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kdm2aP59997 1161 aa21.36■■□□□ 1.01
Ptprn-201ENSMUST00000027404 B4galnt3Q6L8S8 986 aa21.36■■□□□ 1.01
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mug2P28666 1451 aa21.28■■□□□ 1
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pank3Q8R2W9 370 aa21.27■■□□□ 1
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa21.27■■□□□ 1
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zscan21Q07231 555 aa21.27■□□□□ 0.99
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa21.26■□□□□ 0.99
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fhod3Q76LL6 1578 aa21.25■□□□□ 0.99
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