RNA–Protein interactions for RNA: YMR117C

SPC24, Transcript of Component of the kinetochore-associated Ndc80 complex, yeast

Gene SPC24, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPC24	YMR117C	SPO22	P40511	975 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	MET28	P40573	187 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	APE1	P14904	514 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	MUM2	P38236	366 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	IKS1	P47042	667 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	AIM22	P47051	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	PET130	P47065	347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	YGL260W	P53056	76 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	TIP41	Q12199	356 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPC24	YMR117C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	ARG3	P05150	338 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	MRE11	P32829	692 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	BNA4	P38169	460 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	CST26	P38226	397 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	YEL057C	P39983	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	IVY1	Q04934	453 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	YCR007C	P25354	239 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	ELO2	P25358	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	NDE1	P40215	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	ESL1	P40456	1118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
SPC24	YMR117C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	SEC39	Q12745	709 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	RTP1	Q12751	981 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	RAV1	P47104	1357 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	MRS3	P10566	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	PTR2	P32901	601 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	VPS52	P39904	641 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	IRC6	P43615	237 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	SUC2	P00724	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	COR1	P07256	457 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	UTR4	P32626	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	DUG2	P38149	878 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	ERP2	P39704	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	TWF1	P53250	332 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	SLD5	Q03406	294 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	ATG29	Q12092	213 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	NDC1	P32500	655 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	FRE1	P32791	686 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	MSN2	P33748	704 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	VID24	P38263	362 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	MDM31	P38880	579 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	MET18	P40469	1032 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	PDS5	Q04264	1277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	BNA5	Q05979	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	SYO1	Q07395	620 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	RIM20	Q12033	661 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	EXO70	P19658	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	CMC1	P36064	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	MBB1	P39534	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	RTT101	P47050	842 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	GPI1	P53306	609 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	MRPL19	P53875	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	PHO92	Q06390	306 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPC24	YMR117C	INH1	P01097	85 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPC24	YMR117C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPC24	YMR117C	JJJ1	P53863	590 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPC24	YMR117C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPC24	YMR117C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPC24	YMR117C	PPT2	Q12036	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPC24	YMR117C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPC24	YMR117C	PHO2	P07269	559 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPC24	YMR117C	CKA1	P15790	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPC24	YMR117C	GPI10	P30777	616 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPC24	YMR117C	SEC66	P33754	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPC24	YMR117C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPC24	YMR117C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPC24	YMR117C	VPS74	Q06385	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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