RNA–Protein interactions for RNA: YLR347W-A

YLR347W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR347W-A, Length 141 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR347W-AYLR347W-A HOS2P53096 452 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A SMM1P53720 384 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A YVH1Q02256 364 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A SSK1Q07084 712 aa3.7□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A MED1Q12321 566 aa3.7□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A ARP6Q12509 438 aa3.7□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A YJR112W-AQ3E743 109 aa3.7□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A NUP188P52593 1655 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A USO1P25386 1790 aa3.7□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A DNF3Q12674 1656 aa3.69□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A CBS1P14066 229 aa3.69□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A EST1P17214 699 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A SEF1P34228 1148 aa3.69□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A UBP11P36026 717 aa3.69□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A MIC60P36112 540 aa3.69□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A CIN4P39110 191 aa3.69□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A YER130CP39959 443 aa3.69□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A AZF1P41696 914 aa3.69□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A GUF1P46943 645 aa3.69□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A VPS75P53853 264 aa3.69□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A DUG3P53871 357 aa3.69□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A PDR5P33302 1511 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A PDR11P40550 1411 aa3.69□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A GCN2P15442 1659 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A GCN4P03069 281 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A MRP13P12686 339 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A HSC82P15108 705 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A GLN3P18494 730 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A ART10P18634 518 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A TYR1P20049 452 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A RPS2P25443 254 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A YUR1P26725 428 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A ERG1P32476 496 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A REG2P38232 338 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A YBR225WP38321 900 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data3.68□□□□□ -1.82not detected
YLR347W-AYLR347W-A ALG5P40350 334 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A AXL1P40851 1208 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A MAF1P41910 395 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A MEP2P41948 499 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A SNG1P46950 547 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A SCS3P53012 380 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A YGR066CP53242 292 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A YGR126WP53274 230 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A ARE2P53629 642 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A RHO4Q00246 291 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A YPL014WQ02606 381 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A MSS11Q03825 758 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A DIC1Q06143 298 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A CDC45Q08032 650 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A NDD1Q08887 554 aa3.68□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A SUI2P20459 304 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A PPZ1P26570 692 aa3.67□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A PEP3P27801 918 aa3.67□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A SEC1P30619 724 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A ACH1P32316 526 aa3.67□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A TRS65P32893 560 aa3.67□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A GCS1P35197 352 aa3.67□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A YKL023WP36103 277 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A NPR2P39923 615 aa3.67□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.67□□□□□ -1.82not detected
YLR347W-AYLR347W-A CUL3P53202 744 aa3.67□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A IPI3P53877 555 aa3.67□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A FMP45Q07651 309 aa3.67□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A SDH5Q08230 162 aa3.67□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A NRT1Q08485 598 aa3.67□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data3.67□□□□□ -1.82not detected
YLR347W-AYLR347W-A CSR2Q12734 1121 aa3.67□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A IML1P47170 1584 aa3.67□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A PEP5P12868 1029 aa3.66□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A SGV1P23293 657 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A TCD2P36101 447 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A RIM2P38127 377 aa3.66□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A SRO77P38163 1010 aa3.66□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A RTT107P38850 1070 aa3.66□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A YAT2P40017 923 aa3.66□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A STB2P46679 850 aa3.66□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A IMD4P50094 524 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A TDA7P53882 636 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A SAM50P53969 484 aa3.66□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A SHR3Q02774 210 aa3.66□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A MFB1Q04922 465 aa3.66□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A RLM1Q12224 676 aa3.66□□□□□ -1.82
YLR347W-AYLR347W-A DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data3.65□□□□□ -1.83not detected
YLR347W-AYLR347W-A PDA1P16387 420 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A OCA4P25366 362 aa3.65□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A RRP3P38712 501 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A YHR210CP38893 341 aa3.65□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A YTA12P40341 825 aa3.65□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A BUD32P53323 261 aa3.65□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A TIM10P87108 93 aa3.65□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A COQ9Q05779 260 aa3.65□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A VPS38Q05919 439 aa3.65□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A YDL057WQ07379 328 aa3.65□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A YEH2Q07950 538 aa3.65□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A THI20Q08224 551 aa3.65□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A YOR365CQ08844 703 aa3.65□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A PDH1Q12428 516 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 55.3 ms