RNA–Protein interactions for RNA: YGL103W

RPL28, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L28, yeast

Gene RPL28, Length 450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL28	YGL103W	IBD2	P53892	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	SLG1	P54867	378 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	PET117	Q02771	107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	ARP10	Q04549	284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	BCH1	Q05029	724 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	APC5	Q08683	685 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	TRE2	Q08693	809 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	UAF30	Q08747	228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	SAM3	Q08986	587 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	MED2	Q12124	431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	NBP2	Q12163	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	ARP7	Q12406	477 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	FRT1	Q99332	602 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	CLN2	P20438	545 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	SGF29	P25554	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	PPZ1	P26570	692 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	YUR1	P26725	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	PTM1	P32857	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	PET112	P33893	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	SKT5	P34226	696 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	FLR1	P38124	548 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	ROT2	P38138	954 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	RIM4	P38741	713 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	HAT2	P39984	401 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	YEL023C	P39992	682 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	YER186C	P40101	306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	JLP2	P40206	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	GCD10	P41814	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	MSE1	P48525	536 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	TWF1	P53250	332 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	EFM6	P53970	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	CDC14	Q00684	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	YML131W	Q03102	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	ARA2	Q04212	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	GAL83	Q04739	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	PEX10	Q05568	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	MRX10	Q05648	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	RIF2	Q06208	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	SWC7	Q06707	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	MNL2	Q12205	849 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	NFI1	Q12216	726 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	BBP1	Q12365	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
RPL28	YGL103W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	MOT1	P32333	1867 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	RAD7	P06779	565 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	HMG2	P12684	1045 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	TOP3	P13099	656 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	YIH1	P25637	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	RAD27	P26793	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	HIR2	P32480	875 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	TFA2	P36145	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	YBR053C	P38235	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	ECM8	P38246	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	SLX1	P38324	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	MUP3	P38734	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	PET100	P38958	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	MNN1	P39106	762 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	YAR028W	P39548	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	BOL3	P39724	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	CDC1	P40986	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	FAR7	P43592	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	NET1	P47035	1189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	ISM1	P48526	1002 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	FPK1	P53739	893 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	YNR068C	P53754	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	ARP4	P80428	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	MET14	Q02196	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	PML39	Q03760	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	VTA1	Q06263	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL28	YGL103W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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