RNA–Protein interactions for RNA: YHR134W

WSS1, Transcript of Metalloprotease involved in DNA repair, removes DNA-protein crosslinks at stalled replication forks during replication of damaged DNA, yeast

Gene WSS1, Length 810 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WSS1	YHR134W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	MCP2	Q06567	569 aa		4.76	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.76	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.76	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.75	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	YCR043C	P25361	127 aa		4.75	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	ESL2	P36168	1195 aa		4.75	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	KEL2	P50090	882 aa		4.75	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	YNL181W	P53878	407 aa		4.75	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	INN1	P53901	409 aa		4.75	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	SNO4	Q04902	237 aa		4.75	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	SNA4	Q07549	140 aa		4.75	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	HSP32	Q08992	237 aa		4.75	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	ATG9	Q12142	997 aa		4.75	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	PEX5	P35056	612 aa		4.74	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	MIA40	P36046	403 aa		4.74	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	RPC37	P36121	282 aa		4.74	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	RKM3	P38222	552 aa		4.74	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	YHR218W	P38899	603 aa		4.74	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	FMP10	P40098	244 aa		4.74	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	MEP1	P40260	492 aa		4.74	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	YFR020W	P43600	232 aa		4.74	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	SIP4	P46954	829 aa		4.74	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	ZDS2	P54786	942 aa		4.74	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	IZH1	Q03419	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	SSP2	Q08646	371 aa		4.74	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	RER1	P25560	188 aa		4.73	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	ANP1	P32629	500 aa		4.73	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	PIM1	P36775	1133 aa		4.73	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	YPK3	P38070	525 aa		4.73	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	PHO90	P39535	881 aa		4.73	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	YTP1	P53584	459 aa		4.73	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.73	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	RTP1	Q12751	981 aa		4.73	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	YKL050C	P35736	922 aa		4.72	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	EFM2	P38347	419 aa		4.72	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	ARP1	P38696	384 aa		4.72	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	PES4	P39684	611 aa		4.72	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	HXT9	P40885	567 aa		4.72	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	SRB7	P47822	140 aa		4.72	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	ESBP6	P53918	673 aa		4.72	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	BET4	Q00618	327 aa		4.72	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.72	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	RSF1	Q05043	376 aa		4.72	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.72	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	GRC3	Q07845	632 aa		4.72	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	INP53	Q12271	1107 aa		4.72	□□□□□ -1.65
WSS1	YHR134W	FOB1	O13329	566 aa		4.71	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	INH1	P01097	85 aa		4.71	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	CBP1	P07252	654 aa		4.71	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	ALY1	P36117	915 aa		4.71	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	MET30	P39014	640 aa		4.71	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	AIM20	P40451	204 aa		4.71	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	IAH1	P41734	238 aa		4.71	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	STB2	P46679	850 aa		4.71	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	CHD1	P32657	1468 aa		4.7	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	YKL100C	P34248	587 aa		4.7	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	RGI2	P40188	164 aa		4.7	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	YJR061W	P40355	935 aa		4.7	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	VID30	P53076	958 aa		4.7	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	CBK1	P53894	756 aa		4.7	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	SPC19	Q03954	165 aa		4.7	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	VTI1	Q04338	217 aa		4.7	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	GRS2	Q06817	618 aa		4.7	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	APL4	Q12028	832 aa		4.7	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	RPB8	P20436	146 aa		4.69	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	SSH4	P32343	579 aa		4.69	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	NIP100	P33420	868 aa		4.69	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	YIL169C	P40442	995 aa		4.69	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	MEP2	P41948	499 aa		4.69	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	SGM1	P47166	707 aa		4.69	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	SGF73	P53165	657 aa		4.69	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.69	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.69	□□□□□ -1.66
WSS1	YHR134W	RRI2	Q12348	645 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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