RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C RCF2P53721 224 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ZRG17P53735 605 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C BNI4P53858 892 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C JJJ1P53863 590 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YNL143CP53908 130 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C EAF7P53911 425 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C AQR1P53943 586 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C VAC7P53950 1165 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MPS1P54199 764 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YAT1P80235 687 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NAM8Q00539 523 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C BET4Q00618 327 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SDH1Q00711 640 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data0.7□□□□□ -2.3not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C RSC4Q02206 625 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SMA1Q02651 245 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SHR3Q02774 210 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RLI1Q03195 608 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CCE1Q03702 353 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PPN1Q04119 674 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NHX1Q04121 633 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C URH1Q04179 340 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TRM12Q04235 462 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C BUD22Q04347 519 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SPO20Q04359 397 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR027WQ04371 470 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YDR109CQ04585 715 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CIA1Q05583 330 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CDC123Q05791 360 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ADE13Q05911 482 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C UTP13Q05946 817 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C BLS1Q06071 122 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YPR114WQ06107 315 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C OPT2Q06593 877 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GRS2Q06817 618 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SYT1Q06836 1226 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YDL121CQ07541 149 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ADY3Q07732 790 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C FRA1Q07825 749 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ATG10Q07879 167 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C LDB18Q07887 179 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C THI73Q07904 523 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PEX15Q08215 383 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C AAD15Q08361 143 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C HRK1Q08732 759 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C BUD7Q08754 746 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GPB1Q08886 897 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ACM1Q08981 209 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C DIN7Q12086 430 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YPR022CQ12139 1133 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C UPC2Q12151 913 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C HOS1Q12214 470 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YOL107WQ12239 342 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SFI1Q12369 946 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GTT2Q12390 233 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C STB3Q12427 513 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SKM1Q12469 655 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C KCS1Q12494 1050 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YPL247CQ12523 523 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MHT1Q12525 324 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C DYN1P36022 4092 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TOR1P35169 2470 aa0.7□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C UBR2Q07963 1872 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GCN1P33892 2672 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YPR089WO13585 888 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YPR096CO13587 100 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CDC8P00572 216 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PRT1P06103 763 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CPA1P07258 411 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GAL7P08431 366 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CUP1-1P0CX80 61 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CUP1-2P0CX81 61 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RPO26P20435 155 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CLN2P20438 545 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SLY41P22215 453 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ARG1P22768 420 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C DBR1P24309 405 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ERG6P25087 383 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YCR006CP25350 157 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RRP43P25359 394 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C OCA4P25366 362 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ADH7P25377 361 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C DCC1P25559 380 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C KAR4P25583 335 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YCL068CP25593 260 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C STP22P25604 385 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ILV6P25605 309 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YCR099CP25657 155 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MSH1P25846 959 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MGT1P26188 188 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PHO91P27514 894 aa0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.7 ms