RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPT53	YNL093W	SKM1	Q12469	655 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
YPT53	YNL093W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CMK2	P22517	447 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CLB4	P24871	460 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	TGL1	P34163	548 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YKL063C	P35725	167 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	IFA38	P38286	347 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	EXO5	P38289	585 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	BZZ1	P38822	633 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PSD1	P39006	500 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	FLC2	P39719	783 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PCL6	P40038	420 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MPH1	P40562	993 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CEP3	P40969	608 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YFR018C	P43599	363 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	LOH1	P47055	219 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MPS3	P47069	682 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	ALT2	P52892	507 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	IPI3	P53877	555 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	VAC7	P53950	1165 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PET117	Q02771	107 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	TFC6	Q06339	672 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	ATG29	Q12092	213 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	GNT1	Q12096	491 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	ACF2	Q12168	779 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CTF3	Q12748	733 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	RAD61	Q99359	647 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	GAL4	P04386	881 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	RAD3	P06839	778 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	INO1	P11986	533 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	STE12	P13574	688 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	RSR1	P13856	272 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	VPS34	P22543	875 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PHO3	P24031	467 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CSE1	P33307	960 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PMT1	P33775	817 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
YPT53	YNL093W	SQT1	P35184	431 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	RER2	P35196	286 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MAL32	P38158	584 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	LYS9	P38999	446 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YER085C	P40058	173 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PUG1	P40100	303 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PIG2	P40187	538 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YIL092W	P40497	633 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	SSN8	P47821	323 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	BRO1	P48582	844 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CTF18	P49956	741 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MRK1	P50873	501 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	TAD1	P53065	400 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MAL12	P53341	584 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YNL181W	P53878	407 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	AQR1	P53943	586 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	INA17	Q02888	182 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YHM2	Q04013	314 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	SPC24	Q04477	213 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YEH2	Q07950	538 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MCH5	Q08777	521 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	GET4	Q12125	312 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.05	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20 ms