RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	GPI13	Q07830	1017 aa		5.54	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	OCA6	Q12454	224 aa		5.54	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	SCEI	P03882	235 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	ARG3	P05150	338 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	CDC42	P19073	191 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.53	□□□□□ -1.52	not detected
VBA1	YMR088C	FUN26	P31381	517 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	HXT1	P32465	570 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	CTF13	P35203	478 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	ELF1	P36053	145 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	MRPL10	P36520	322 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	HMT1	P38074	348 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	UBS1	P38290	277 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	SUL1	P38359	859 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.53	□□□□□ -1.52	not detected
VBA1	YMR088C	SBE22	P38814	852 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	RPH1	P39956	796 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	MSS2	P40990	351 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	NUT1	P53114	1132 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	ZRG17	P53735	605 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	YNL034W	P53963	612 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	YNL018C	P53976	612 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	PET117	Q02771	107 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	BNA7	Q04066	261 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	ECM18	Q04623	453 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	RCO1	Q04779	684 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	SMC5	Q08204	1093 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	CBF1	P17106	351 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	CLN2	P20438	545 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	EMC1	P25574	760 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	KIP1	P28742	1111 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	THI4	P32318	326 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	RAD24	P32641	659 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	RCN1	P36054	211 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	NEM1	P38757	446 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	TAT2	P38967	592 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	SEN34	P39707	275 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	CIR1	P42940	261 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	AIM24	P47127	394 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	YGR237C	P50089	785 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	YGR125W	P53273	1036 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	YGR127W	P53275	312 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	MRPL19	P53875	158 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	RSN1	Q03516	953 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	YMD8	Q03697	442 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	RUB1	Q03919	77 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	SNX41	Q04053	625 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	TDA9	Q04545	1251 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	SWF1	Q04629	336 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	YLR001C	Q07895	862 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	SGT1	Q08446	395 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	TGS1	Q12052	315 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	HUA2	Q12134	243 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	PNS1	Q12412	539 aa		5.53	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	MDS3	P53094	1487 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	KIN28	P06242	306 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	RAD7	P06779	565 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	HSF1	P10961	833 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	RPO26	P20435	155 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	CMK2	P22517	447 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	ARG1	P22768	420 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	CTR86	P25355	563 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	KAP122	P32767	1081 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	ALG8	P40351	577 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	ATM1	P40416	690 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	NAS2	P40555	220 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	IRC6	P43615	237 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	MPS3	P47069	682 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	CCC1	P47818	322 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	NAS6	P50086	228 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	MTO1	P53070	669 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	MEP3	P53390	489 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	WAR1	Q03631	944 aa		5.52	□□□□□ -1.53
VBA1	YMR088C	RAD30	Q04049	632 aa		5.52	□□□□□ -1.53

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.6 ms