RNA–Protein interactions for RNA: YOR087W

YVC1, Transcript of Vacuolar cation channel, yeast

Gene YVC1, Length 2,028 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YVC1	YOR087W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	CDC15	P27636	974 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	PEP3	P27801	918 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	BYE1	P36106	594 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	SPO22	P40511	975 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	NGL3	Q03210	505 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	CRT10	Q08226	957 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	MAM1	P40065	302 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	DJP1	P40564	432 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	IME4	P41833	600 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	PHO23	P50947	330 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YML6	P51998	286 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	NMA2	P53204	395 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YGR079W	P53249	370 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	ERO1	Q03103	563 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	CBS1	P14066	229 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	PDX1	P16451	410 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	HCM1	P25364	564 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	THI80	P35202	319 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	ARG2	P40360	574 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YNR061C	P53747	219 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	TCO89	Q08921	799 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	RTN2	Q12443	393 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	AAC1	P04710	309 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	KAR3	P17119	729 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	STE4	P18851	423 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	SIP1	P32578	815 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	PPS1	P38148	807 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	SUL1	P38359	859 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	PIH1	P38768	344 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	JHD1	P40034	492 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	GLO1	P50107	326 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	RCF1	Q03713	159 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	BAG7	Q12128	409 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	NTO1	Q12311	748 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	LAM4	P38800	1345 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	DBF4	P32325	704 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	MAL33	P38157	468 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	RGI2	P40188	164 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	LAS21	P40367	830 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	TRS23	Q03784	219 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	GMH1	P36125	273 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YPT10	P38146	199 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	NDC80	P40460	691 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	PMT6	P42934	759 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	CTR1	P49573	406 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	INA17	Q02888	182 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	ANP1	P32629	500 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	HES1	P35843	434 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	AGP2	P38090	596 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	UBP13	P38187	747 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	REG2	P38232	338 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	CAJ1	P39101	391 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	UBX6	P47049	396 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	MSE1	P48525	536 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YGR066C	P53242	292 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	ESC8	Q08119	714 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	AMD2	P22580	549 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	POL4	P25615	582 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	ELM1	P32801	640 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YNL092W	P53934	400 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	ZDS2	P54786	942 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	UBP16	Q02863	499 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	CRN1	Q06440	651 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YVC1	YOR087W	YEH1	Q07804	573 aa		4.11	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.8 ms