RNA–Protein interactions for RNA: YMR054W

STV1, Transcript of Subunit a of the vacuolar-ATPase V0 domain, yeast

Gene STV1, Length 2,673 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STV1	YMR054W	VPS4	P52917	437 aa		4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	YLR302C	O13544	120 aa		4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	PRE4	P30657	266 aa		4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	YME1	P32795	747 aa		4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	MRPL36	P36531	177 aa		4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	JHD1	P40034	492 aa		4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	LEM3	P42838	414 aa		4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	MET12	P46151	657 aa		4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	YJL171C	P46992	396 aa		4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	ECM18	Q04623	453 aa		4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.39	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	DIT1	P21623	536 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	YKR075C	P36155	307 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	MRPL40	P36534	297 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	CAB2	P40506	365 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	EXG2	P52911	562 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	LCL3	P53153	274 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	MSC3	Q05812	728 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	STP3	Q05937	343 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	VPS36	Q06696	566 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	AIM6	Q07716	390 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	AFI1	Q99222	893 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	PEP3	P27801	918 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	LRG1	P35688	1017 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	VPS45	P38932	577 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	TAF4	P50105	388 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	TEL2	P53038	688 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	ORC4	P54791	529 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	SDH1	Q00711	640 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	TRS31	Q03337	283 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	UFO1	Q04511	668 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	UAF30	Q08747	228 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	UPC2	Q12151	913 aa		4.38	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	VTH1	P40438	1549 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	VTH2	P40890	1549 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	HMG2	P12684	1045 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	CLB3	P24870	427 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	BUD14	P27637	709 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	PRE3	P38624	215 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	FKH1	P40466	484 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	PEX19	Q07418	342 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	HER1	Q12276	1246 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	YPT6	Q99260	215 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	PHO91	P27514	894 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	RPC82	P32349	654 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	GPT2	P36148	743 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	PEX32	P38292	413 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	YHR033W	P38690	423 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	YHR054C	P38780	354 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	YEH1	Q07804	573 aa		4.37	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	SPP41	P38904	1435 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	EDE1	P34216	1381 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	UBP11	P36026	717 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	PIM1	P36775	1133 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	YBL028C	P38202	106 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	VID24	P38263	362 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	GIP2	P40036	548 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	GIS4	Q04233	774 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	BUD7	Q08754	746 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	RIM20	Q12033	661 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	ELG1	Q12050	791 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	NBP2	Q12163	236 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	PET127	P32606	800 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	SFA1	P32771	386 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	RRT2	P38332	387 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	YNL195C	P40168	261 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	TAH11	P47112	604 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	YBP2	P53169	641 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	TNA1	P53322	534 aa		4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
STV1	YMR054W	TMA16	Q08687	178 aa		4.36	□□□□□ -1.71

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