RNA–Protein interactions for RNA: YDR507C

GIN4, Transcript of Protein kinase involved in bud growth and assembly of the septin ring, yeast

Gene GIN4, Length 3,429 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GIN4	YDR507C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
GIN4	YDR507C	ERP3	Q12403	225 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIN4	YDR507C	ADH4	P10127	382 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIN4	YDR507C	AEP2	P22136	580 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIN4	YDR507C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
GIN4	YDR507C	IES1	P43579	692 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIN4	YDR507C	TOS3	P43637	560 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIN4	YDR507C	VPS4	P52917	437 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIN4	YDR507C	TIM8	P57744	87 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIN4	YDR507C	ARG5,6	Q01217	863 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIN4	YDR507C	TDA9	Q04545	1251 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIN4	YDR507C	GAD1	Q04792	585 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIN4	YDR507C	COQ9	Q05779	260 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIN4	YDR507C	ATG23	Q06671	453 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIN4	YDR507C	SMC5	Q08204	1093 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIN4	YDR507C	SGO1	Q08490	590 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIN4	YDR507C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	HCM1	P25364	564 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	PLC1	P32383	869 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	YME1	P32795	747 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	OAF3	P36023	863 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	FAT1	P38225	669 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	YHR054C	P38780	354 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	KAP114	P53067	1004 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	PCD1	Q12524	340 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	PMS1	P14242	873 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	DCG1	P32460	244 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	RGT1	P32862	1170 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	TRM2	P33753	639 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	STV1	P37296	890 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	MUP1	P50276	574 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	JJJ1	P53863	590 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	SND1	Q04007	877 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	VHS3	Q08438	674 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	YPR027C	Q12079	277 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	TRM13	Q12383	476 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	CDC8	P00572	216 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	MET3	P08536	511 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	SNA3	P14359	133 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	PET123	P17558	318 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	CTS1	P29029	562 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	BEM4	P39011	633 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	SPC105	P53148	917 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	CUL3	P53202	744 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	PGA2	P53903	129 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	ARK1	P53974	638 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	TLG2	Q08144	397 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	IES4	Q08561	116 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	TOP1	P04786	769 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	SWI6	P09959	803 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	KAR1	P11927	433 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	CDC42	P19073	191 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	PSO2	P30620	661 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	MRP4	P32902	394 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	NIP100	P33420	868 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	PCH2	P38126	564 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	PPS1	P38148	807 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	YSW1	P38280	609 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	ARG2	P40360	574 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	IRC24	P40580	263 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	NIT2	P47016	307 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	MRX6	P48564	524 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	TAM41	P53230	385 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	REC102	Q02721	264 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	DLT1	Q04216	342 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	ESC8	Q08119	714 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	AIM39	Q08223	395 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	ECM3	Q99252	613 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	ERG11	P10614	530 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	PIH1	P38768	344 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	DUN1	P39009	513 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	SEC9	P40357	651 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	YIL089W	P40500	205 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	PEX8	P53248	589 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	YGR111W	P53265	400 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIN4	YDR507C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.76	□□□□□ -1.97	not detected

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