RNA–Protein interactions for RNA: YDR177W

UBC1, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme, yeast

Gene UBC1, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBC1	YDR177W	YEH1	Q07804	573 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
UBC1	YDR177W	VMA16	P23968	213 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	POL4	P25615	582 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	LOT5	P34234	306 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	GCS1	P35197	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	STB6	P36085	766 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	SDH8	P38345	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	PLB1	P39105	664 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	MPS3	P47069	682 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	JJJ1	P53863	590 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	INN1	P53901	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	GYL1	Q04322	720 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	DUS4	Q06063	367 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	TGS1	Q12052	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	ATG29	Q12092	213 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	SWR1	Q05471	1514 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	SGS1	P35187	1447 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBC1	YDR177W	CDC6	P09119	513 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	YCR051W	P25631	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	SIP1	P32578	815 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	CTP1	P38152	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	ERC1	P38767	581 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	DOT5	P40553	215 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	UBX6	P47049	396 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	GPI8	P49018	411 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	SPT20	P50875	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	MRPL22	P53881	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	ARG7	Q04728	441 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	AVL9	Q12500	764 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	DAL5	P15365	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	KAR3	P17119	729 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	CDC20	P26309	610 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	MGM1	P32266	881 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	TFB1	P32776	642 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	UBP13	P38187	747 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	CST26	P38226	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	ELO3	P40319	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	LCB2	P40970	561 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	ZIM17	P42844	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	MSE1	P48525	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	MUP1	P50276	574 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	MRPS35	P53292	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	MAK10	Q02197	733 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	MFM1	Q02783	413 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	VPS38	Q05919	439 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	STP3	Q05937	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	IZH3	Q07959	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	BAG7	Q12128	409 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	YPT6	Q99260	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	FUB1	P25659	250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	DPH2	P32461	534 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	CMC1	P36064	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	CCL1	P37366	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	SKN7	P38889	622 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	YEL057C	P39983	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	SPC98	P53540	846 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	RIA1	P53893	1110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	INA17	Q02888	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	CPR2	P23285	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	SYN8	P31377	255 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	SEF1	P34228	1148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	MRPL7	P36519	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	APL3	P38065	1025 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	BUD16	P39988	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	MAM1	P40065	302 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBC1	YDR177W	LAS21	P40367	830 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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