RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000074721.5

Hoxd8-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Defb1P56386 69 aa15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Brk1Q91VR8 75 aa15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1700042G07RikB1AUF7 90 aa15.08■□□□□ 0.01
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cdc42se1Q8BHL7 80 aa15.06■□□□□ 0
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap1-4Q3V2D6 188 aa15.01□□□□□ -0.01
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap1-5A2A590 122 aa14.98□□□□□ -0.01
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap3-1A2A591 98 aa14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cox6b2Q80ZN9 88 aa14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm10197F6QEY5 67 aa14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 SptssbQ925E8 76 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 H2al1aQ5M8Q2 105 aa14.79□□□□□ -0.04
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm20661K7N787 53 aa14.72□□□□□ -0.05
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Phxr4P15974 95 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 SspoQ8CG65 4998 aa14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm10061D3Z714 54 aa14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm17606F6ZL36 78 aa14.58□□□□□ -0.08
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 SvipQ3UZP4 77 aa14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 H2al1eQ810S6 105 aa14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm10382Q3V0T5 144 aa14.45□□□□□ -0.1
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 H2al1bA0A087WP11 105 aa14.32□□□□□ -0.12
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm19426M0QWC7 77 aa14.29□□□□□ -0.12
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ndufb1P0DN34 57 aa14.28□□□□□ -0.12
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm10337F7DEP7 55 aa14.26□□□□□ -0.13
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 BC029722A0A0N4SW31 51 aa14.25□□□□□ -0.13
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Limd2Q8BGB5 128 aa14.24□□□□□ -0.13
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Uqcr11Q9CPX8 56 aa14.24□□□□□ -0.13
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm20537G3UYK7 97 aa14.23□□□□□ -0.13
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sox16Q62247 57 aa14.23□□□□□ -0.13
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 H2al1kJ3QP08 105 aa14.17□□□□□ -0.14
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 H2al1mQ9DAD9 105 aa14.17□□□□□ -0.14
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm11569B1AQB1 180 aa14.06□□□□□ -0.16
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lce1jD3YUU5 139 aa14.06□□□□□ -0.16
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 4933415A04RikQ9D443 101 aa14.01□□□□□ -0.17
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap12-1Q9Z287 130 aa13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sec61gP60060 68 aa13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap17-1A2A5X6 109 aa13.88□□□□□ -0.19
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap19-2Q925I0 141 aa13.87□□□□□ -0.19
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap9-5A2A5X3 358 aa13.82□□□□□ -0.2
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 CriptO70333 101 aa13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Spink7Q6IE32 76 aa13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm9955Q8CEJ8 102 aa13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap19-9aF8WH65 55 aa13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Prm2P07978 107 aa13.6□□□□□ -0.23
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 B930094E09RikQ8C4T2 136 aa13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Pla2g10Q9QXX3 151 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Muc5bE9Q5I3 4800 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm3646F6S692 53 aa13.38□□□□□ -0.27
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sprr2a3Q4KL71 83 aa13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sprr2a1Q9CQK8 83 aa13.37□□□□□ -0.27
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm17402F6Z0L5 76 aa13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap4-2B1AQ85 167 aa13.32□□□□□ -0.28
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ndufs5Q99LY9 106 aa13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lce1gQ9D195 139 aa13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm11562A0PK51 136 aa13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lce1iQ9D6P5 149 aa13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm6358A0A087WPH4 74 aa13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm11555B1AQ89 175 aa13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lce1a2Q9D1K4 149 aa13□□□□□ -0.33
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm3880A0A1B0GSB3 72 aa12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mdn1A2ANY6 5589 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap4-6Q3V4B7 195 aa12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Syne2Q6ZWQ0 6874 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm11596B1AQB0 205 aa12.81□□□□□ -0.36
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm19668J3QMD1 248 aa12.74□□□□□ -0.37
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mt2P02798 61 aa12.69□□□□□ -0.38
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap4-1Q3UUY3 169 aa12.64□□□□□ -0.39
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm21887J3QQ04 176 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Camk2n1Q6QWF9 78 aa12.35□□□□□ -0.43
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm12216A0A1W2P827 62 aa12.34□□□□□ -0.43
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm11564A2A4L9 201 aa12.31□□□□□ -0.44
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm11563B1AQ90 168 aa12.31□□□□□ -0.44
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm11595B1AQA7 289 aa12.31□□□□□ -0.44
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap4-8B1AQA8 209 aa12.31□□□□□ -0.44
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap8-1O08633 61 aa12.25□□□□□ -0.45
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Romo1P60603 79 aa12.24□□□□□ -0.45
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap19-9bQ99NG9 58 aa12.1□□□□□ -0.47
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap22-2J3QNX6 67 aa12.02□□□□□ -0.48
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap4-9B1AQA9 244 aa11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap9-3Q3V2C1 136 aa11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mt4P47945 62 aa11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Fsip2A2ARZ3 6995 aa11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lce1bQ9D149 137 aa11.6□□□□□ -0.55
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa11.52□□□□□ -0.57
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm38119A0A0A6YX29 146 aa11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lce1hQ9D6R3 140 aa11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap7-1Q9D3I6 87 aa11.24□□□□□ -0.61
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sprr2kO70562 68 aa11.23□□□□□ -0.61
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 2300003K06RikA2A4M0 262 aa11.23□□□□□ -0.61
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm40193A0A1B0GT39 78 aa11.17□□□□□ -0.62
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa11.16□□□□□ -0.62
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap4-7Q9D732 168 aa10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mp68P56379 58 aa10.97□□□□□ -0.65
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Tnp1P10856 55 aa10.9□□□□□ -0.66
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lce1lQ9D1G7 135 aa10.9□□□□□ -0.66
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm10272F7CZ33 110 aa10.71□□□□□ -0.69
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lce1dQ9D731 133 aa10.57□□□□□ -0.72
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 A0A1Y7VJH8 109 aa10.44□□□□□ -0.74
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sprr2gO70558 76 aa10.44□□□□□ -0.74
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Syne1Q6ZWR6 8799 aa10.42□□□□□ -0.74
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 2310046K23RikA0A0A6YVW6 87 aa10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.6 ms