Protein–RNA interactions for Protein: A2A4M0

2300003K06Rik, MCG1025736, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2300003K06RikA2A4M0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
2300003K06RikA2A4M0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2300003K06RikA2A4M0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
2300003K06RikA2A4M0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
2300003K06RikA2A4M0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
2300003K06RikA2A4M0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
2300003K06RikA2A4M0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
2300003K06RikA2A4M0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
2300003K06RikA2A4M0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
2300003K06RikA2A4M0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
2300003K06RikA2A4M0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2300003K06RikA2A4M0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
2300003K06RikA2A4M0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
2300003K06RikA2A4M0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
2300003K06RikA2A4M0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
2300003K06RikA2A4M0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
2300003K06RikA2A4M0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
2300003K06RikA2A4M0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
2300003K06RikA2A4M0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
2300003K06RikA2A4M0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
2300003K06RikA2A4M0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
2300003K06RikA2A4M0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
2300003K06RikA2A4M0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
2300003K06RikA2A4M0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
2300003K06RikA2A4M0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
2300003K06RikA2A4M0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
2300003K06RikA2A4M0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
2300003K06RikA2A4M0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
2300003K06RikA2A4M0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
2300003K06RikA2A4M0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
2300003K06RikA2A4M0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
2300003K06RikA2A4M0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
2300003K06RikA2A4M0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
2300003K06RikA2A4M0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
2300003K06RikA2A4M0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
2300003K06RikA2A4M0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
2300003K06RikA2A4M0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
2300003K06RikA2A4M0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
2300003K06RikA2A4M0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
2300003K06RikA2A4M0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
2300003K06RikA2A4M0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
2300003K06RikA2A4M0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2300003K06RikA2A4M0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2300003K06RikA2A4M0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2300003K06RikA2A4M0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
2300003K06RikA2A4M0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
2300003K06RikA2A4M0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
2300003K06RikA2A4M0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
2300003K06RikA2A4M0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2300003K06RikA2A4M0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
2300003K06RikA2A4M0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
2300003K06RikA2A4M0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
2300003K06RikA2A4M0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
2300003K06RikA2A4M0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
2300003K06RikA2A4M0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
2300003K06RikA2A4M0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
2300003K06RikA2A4M0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
2300003K06RikA2A4M0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
2300003K06RikA2A4M0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2300003K06RikA2A4M0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
2300003K06RikA2A4M0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
2300003K06RikA2A4M0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
2300003K06RikA2A4M0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
2300003K06RikA2A4M0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
2300003K06RikA2A4M0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
2300003K06RikA2A4M0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
2300003K06RikA2A4M0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
2300003K06RikA2A4M0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2300003K06RikA2A4M0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2300003K06RikA2A4M0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
2300003K06RikA2A4M0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
2300003K06RikA2A4M0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
2300003K06RikA2A4M0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
2300003K06RikA2A4M0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
2300003K06RikA2A4M0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
2300003K06RikA2A4M0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
2300003K06RikA2A4M0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
2300003K06RikA2A4M0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
2300003K06RikA2A4M0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
2300003K06RikA2A4M0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
2300003K06RikA2A4M0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
2300003K06RikA2A4M0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
2300003K06RikA2A4M0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
2300003K06RikA2A4M0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
2300003K06RikA2A4M0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
2300003K06RikA2A4M0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
2300003K06RikA2A4M0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
2300003K06RikA2A4M0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
2300003K06RikA2A4M0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
2300003K06RikA2A4M0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
2300003K06RikA2A4M0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
2300003K06RikA2A4M0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
2300003K06RikA2A4M0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
2300003K06RikA2A4M0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
2300003K06RikA2A4M0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
2300003K06RikA2A4M0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
2300003K06RikA2A4M0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
2300003K06RikA2A4M0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
2300003K06RikA2A4M0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
2300003K06RikA2A4M0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms