Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Syne2Q6ZWQ0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne2Q6ZWQ0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syne2Q6ZWQ0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne2Q6ZWQ0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syne2Q6ZWQ0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syne2Q6ZWQ0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne2Q6ZWQ0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne2Q6ZWQ0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne2Q6ZWQ0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne2Q6ZWQ0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne2Q6ZWQ0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne2Q6ZWQ0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syne2Q6ZWQ0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syne2Q6ZWQ0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syne2Q6ZWQ0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syne2Q6ZWQ0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne2Q6ZWQ0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syne2Q6ZWQ0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syne2Q6ZWQ0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Syne2Q6ZWQ0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Syne2Q6ZWQ0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syne2Q6ZWQ0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syne2Q6ZWQ0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne2Q6ZWQ0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne2Q6ZWQ0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syne2Q6ZWQ0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syne2Q6ZWQ0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Syne2Q6ZWQ0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne2Q6ZWQ0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne2Q6ZWQ0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Syne2Q6ZWQ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne2Q6ZWQ0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne2Q6ZWQ0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syne2Q6ZWQ0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syne2Q6ZWQ0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syne2Q6ZWQ0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syne2Q6ZWQ0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syne2Q6ZWQ0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syne2Q6ZWQ0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syne2Q6ZWQ0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Syne2Q6ZWQ0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Syne2Q6ZWQ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syne2Q6ZWQ0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syne2Q6ZWQ0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syne2Q6ZWQ0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syne2Q6ZWQ0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syne2Q6ZWQ0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syne2Q6ZWQ0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syne2Q6ZWQ0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syne2Q6ZWQ0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syne2Q6ZWQ0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syne2Q6ZWQ0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syne2Q6ZWQ0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syne2Q6ZWQ0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syne2Q6ZWQ0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Syne2Q6ZWQ0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Syne2Q6ZWQ0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syne2Q6ZWQ0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syne2Q6ZWQ0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syne2Q6ZWQ0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syne2Q6ZWQ0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne2Q6ZWQ0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne2Q6ZWQ0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne2Q6ZWQ0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syne2Q6ZWQ0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syne2Q6ZWQ0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syne2Q6ZWQ0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syne2Q6ZWQ0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne2Q6ZWQ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne2Q6ZWQ0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syne2Q6ZWQ0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syne2Q6ZWQ0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syne2Q6ZWQ0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne2Q6ZWQ0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne2Q6ZWQ0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne2Q6ZWQ0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne2Q6ZWQ0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne2Q6ZWQ0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne2Q6ZWQ0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne2Q6ZWQ0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syne2Q6ZWQ0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syne2Q6ZWQ0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syne2Q6ZWQ0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syne2Q6ZWQ0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms