Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Syne2Q6ZWQ0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne2Q6ZWQ0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syne2Q6ZWQ0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syne2Q6ZWQ0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne2Q6ZWQ0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syne2Q6ZWQ0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syne2Q6ZWQ0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne2Q6ZWQ0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne2Q6ZWQ0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syne2Q6ZWQ0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne2Q6ZWQ0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne2Q6ZWQ0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne2Q6ZWQ0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syne2Q6ZWQ0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syne2Q6ZWQ0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syne2Q6ZWQ0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syne2Q6ZWQ0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne2Q6ZWQ0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syne2Q6ZWQ0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syne2Q6ZWQ0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Syne2Q6ZWQ0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Syne2Q6ZWQ0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syne2Q6ZWQ0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syne2Q6ZWQ0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syne2Q6ZWQ0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Syne2Q6ZWQ0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syne2Q6ZWQ0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syne2Q6ZWQ0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Syne2Q6ZWQ0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne2Q6ZWQ0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne2Q6ZWQ0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Syne2Q6ZWQ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syne2Q6ZWQ0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syne2Q6ZWQ0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syne2Q6ZWQ0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syne2Q6ZWQ0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syne2Q6ZWQ0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syne2Q6ZWQ0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syne2Q6ZWQ0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syne2Q6ZWQ0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syne2Q6ZWQ0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Syne2Q6ZWQ0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Syne2Q6ZWQ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syne2Q6ZWQ0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syne2Q6ZWQ0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syne2Q6ZWQ0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syne2Q6ZWQ0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syne2Q6ZWQ0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syne2Q6ZWQ0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syne2Q6ZWQ0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syne2Q6ZWQ0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syne2Q6ZWQ0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syne2Q6ZWQ0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syne2Q6ZWQ0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syne2Q6ZWQ0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syne2Q6ZWQ0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syne2Q6ZWQ0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Syne2Q6ZWQ0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Syne2Q6ZWQ0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syne2Q6ZWQ0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syne2Q6ZWQ0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Syne2Q6ZWQ0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Syne2Q6ZWQ0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syne2Q6ZWQ0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne2Q6ZWQ0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne2Q6ZWQ0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syne2Q6ZWQ0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syne2Q6ZWQ0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syne2Q6ZWQ0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Syne2Q6ZWQ0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne2Q6ZWQ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Syne2Q6ZWQ0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syne2Q6ZWQ0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syne2Q6ZWQ0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syne2Q6ZWQ0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne2Q6ZWQ0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne2Q6ZWQ0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syne2Q6ZWQ0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne2Q6ZWQ0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne2Q6ZWQ0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne2Q6ZWQ0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syne2Q6ZWQ0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syne2Q6ZWQ0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syne2Q6ZWQ0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syne2Q6ZWQ0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syne2Q6ZWQ0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syne2Q6ZWQ0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms