Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX6

Krtap22-2, Keratin-associated protein 22-2, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap22-2J3QNX6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap22-2J3QNX6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krtap22-2J3QNX6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Krtap22-2J3QNX6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krtap22-2J3QNX6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap22-2J3QNX6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Krtap22-2J3QNX6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krtap22-2J3QNX6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krtap22-2J3QNX6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krtap22-2J3QNX6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krtap22-2J3QNX6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap22-2J3QNX6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Krtap22-2J3QNX6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Krtap22-2J3QNX6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krtap22-2J3QNX6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Krtap22-2J3QNX6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Krtap22-2J3QNX6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Krtap22-2J3QNX6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Krtap22-2J3QNX6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krtap22-2J3QNX6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krtap22-2J3QNX6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krtap22-2J3QNX6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krtap22-2J3QNX6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krtap22-2J3QNX6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Krtap22-2J3QNX6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krtap22-2J3QNX6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Krtap22-2J3QNX6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Krtap22-2J3QNX6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Krtap22-2J3QNX6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Krtap22-2J3QNX6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Krtap22-2J3QNX6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krtap22-2J3QNX6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krtap22-2J3QNX6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krtap22-2J3QNX6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Krtap22-2J3QNX6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap22-2J3QNX6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap22-2J3QNX6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap22-2J3QNX6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap22-2J3QNX6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap22-2J3QNX6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap22-2J3QNX6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap22-2J3QNX6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap22-2J3QNX6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Krtap22-2J3QNX6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Krtap22-2J3QNX6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Krtap22-2J3QNX6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Krtap22-2J3QNX6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krtap22-2J3QNX6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krtap22-2J3QNX6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krtap22-2J3QNX6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krtap22-2J3QNX6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap22-2J3QNX6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap22-2J3QNX6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap22-2J3QNX6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap22-2J3QNX6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap22-2J3QNX6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap22-2J3QNX6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap22-2J3QNX6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap22-2J3QNX6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Krtap22-2J3QNX6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Krtap22-2J3QNX6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Krtap22-2J3QNX6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Krtap22-2J3QNX6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Krtap22-2J3QNX6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Krtap22-2J3QNX6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Krtap22-2J3QNX6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Krtap22-2J3QNX6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap22-2J3QNX6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Krtap22-2J3QNX6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Krtap22-2J3QNX6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Krtap22-2J3QNX6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Krtap22-2J3QNX6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Krtap22-2J3QNX6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Krtap22-2J3QNX6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap22-2J3QNX6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap22-2J3QNX6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap22-2J3QNX6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Krtap22-2J3QNX6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap22-2J3QNX6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap22-2J3QNX6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap22-2J3QNX6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap22-2J3QNX6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap22-2J3QNX6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap22-2J3QNX6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap22-2J3QNX6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap22-2J3QNX6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Krtap22-2J3QNX6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Krtap22-2J3QNX6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Krtap22-2J3QNX6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Krtap22-2J3QNX6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Krtap22-2J3QNX6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap22-2J3QNX6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap22-2J3QNX6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap22-2J3QNX6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap22-2J3QNX6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap22-2J3QNX6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap22-2J3QNX6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Krtap22-2J3QNX6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krtap22-2J3QNX6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krtap22-2J3QNX6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms