RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2310057N15RikQ9D6T8 200 aa11.85□□□□□ -0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sec61bQ9CQS8 96 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prm1P02319 51 aa11.83□□□□□ -0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ndufs5Q99LY9 106 aa11.82□□□□□ -0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm9789Q8BIG3 52 aa11.81□□□□□ -0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 1700042G07RikB1AUF7 90 aa11.77□□□□□ -0.53
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm7735D3YX18 52 aa11.75□□□□□ -0.53
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hmcn2A2AJ76 5100 aa11.72□□□□□ -0.53
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm17606F6ZL36 78 aa11.71□□□□□ -0.53
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2210017I01RikA0A0A6YVV1 95 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ubr4A2AN08 5180 aa11.59□□□□□ -0.55
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm20537G3UYK7 97 aa11.58□□□□□ -0.56
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap3-1A2A591 98 aa11.57□□□□□ -0.56
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10382Q3V0T5 144 aa11.57□□□□□ -0.56
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm9955Q8CEJ8 102 aa11.57□□□□□ -0.56
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pla2g10Q9QXX3 151 aa11.57□□□□□ -0.56
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Crct1Q6PAI5 102 aa11.51□□□□□ -0.57
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap1-3A2A588 173 aa11.46□□□□□ -0.57
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap16-3Q8C1I6 86 aa11.45□□□□□ -0.58
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 4932415D10RikA0A1W2P6U8 4986 aa11.4□□□□□ -0.58
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap19-1Q925H2 87 aa11.36□□□□□ -0.59
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap19-3Q925H6 87 aa11.33□□□□□ -0.6
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm3880A0A1B0GSB3 72 aa11.28□□□□□ -0.6
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10318A0A1W2P728 225 aa11.28□□□□□ -0.6
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam229aB2KGE5 128 aa11.27□□□□□ -0.6
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap13-1Q8K198 168 aa11.27□□□□□ -0.6
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 ZanO88799 5376 aa11.22□□□□□ -0.61
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 BC029722A0A0N4SW31 51 aa11.13□□□□□ -0.63
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap1-5A2A590 122 aa11.13□□□□□ -0.63
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 LorP18165 486 aa11.13□□□□□ -0.63
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm19402J3QJV4 266 aa11.1□□□□□ -0.63
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fat4Q2PZL6 4981 aa11.01□□□□□ -0.65
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rnf213E9Q555 5152 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap1-4Q3V2D6 188 aa10.94□□□□□ -0.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm12216A0A1W2P827 62 aa10.9□□□□□ -0.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm17402F6Z0L5 76 aa10.88□□□□□ -0.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Romo1P60603 79 aa10.86□□□□□ -0.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 B930094E09RikQ8C4T2 136 aa10.85□□□□□ -0.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm19426M0QWC7 77 aa10.7□□□□□ -0.7
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sprr2a3Q4KL71 83 aa10.54□□□□□ -0.72
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sprr2a1Q9CQK8 83 aa10.54□□□□□ -0.72
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CriptO70333 101 aa10.53□□□□□ -0.72
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10061D3Z714 54 aa10.52□□□□□ -0.72
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 SspoQ8CG65 4998 aa10.52□□□□□ -0.73
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm21887J3QQ04 176 aa10.49□□□□□ -0.73
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Spink7Q6IE32 76 aa10.47□□□□□ -0.73
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lce1jD3YUU5 139 aa10.32□□□□□ -0.76
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap12-1Q9Z287 130 aa10.27□□□□□ -0.77
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm20538F6Z9R1 75 aa10.21□□□□□ -0.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mp68P56379 58 aa10.14□□□□□ -0.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap19-2Q925I0 141 aa10.12□□□□□ -0.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap17-1A2A5X6 109 aa10.12□□□□□ -0.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm11569B1AQB1 180 aa10.1□□□□□ -0.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap19-9aF8WH65 55 aa10.09□□□□□ -0.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap9-5A2A5X3 358 aa10.08□□□□□ -0.8
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prm2P07978 107 aa9.98□□□□□ -0.81
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap7-1Q9D3I6 87 aa9.95□□□□□ -0.82
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm40193A0A1B0GT39 78 aa9.93□□□□□ -0.82
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Camk2n1Q6QWF9 78 aa9.92□□□□□ -0.82
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm19668J3QMD1 248 aa9.91□□□□□ -0.82
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Muc5bE9Q5I3 4800 aa9.75□□□□□ -0.85
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lce1iQ9D6P5 149 aa9.68□□□□□ -0.86
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm6358A0A087WPH4 74 aa9.61□□□□□ -0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lce1a2Q9D1K4 149 aa9.55□□□□□ -0.88
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap4-2B1AQ85 167 aa9.47□□□□□ -0.89
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lce1gQ9D195 139 aa9.44□□□□□ -0.9
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap8-1O08633 61 aa9.37□□□□□ -0.91
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm11555B1AQ89 175 aa9.36□□□□□ -0.91
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ndufaf8A2AMZ4 74 aa9.32□□□□□ -0.92
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm11562A0PK51 136 aa9.31□□□□□ -0.92
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mt2P02798 61 aa9.29□□□□□ -0.92
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tnp1P10856 55 aa9.25□□□□□ -0.93
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap19-9bQ99NG9 58 aa9.24□□□□□ -0.93
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mdn1A2ANY6 5589 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap4-6Q3V4B7 195 aa9.23□□□□□ -0.93
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Syne2Q6ZWQ0 6874 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm11596B1AQB0 205 aa9.14□□□□□ -0.95
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap4-1Q3UUY3 169 aa9.06□□□□□ -0.96
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2310046K23RikA0A0A6YVW6 87 aa8.83□□□□□ -1
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm11564A2A4L9 201 aa8.82□□□□□ -1
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm11563B1AQ90 168 aa8.82□□□□□ -1
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm11595B1AQA7 289 aa8.82□□□□□ -1
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap4-8B1AQA8 209 aa8.82□□□□□ -1
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap22-2J3QNX6 67 aa8.8□□□□□ -1
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap9-3Q3V2C1 136 aa8.68□□□□□ -1.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lce1hQ9D6R3 140 aa8.63□□□□□ -1.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap4-9B1AQA9 244 aa8.57□□□□□ -1.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm9112A2AI92 75 aa8.57□□□□□ -1.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mt4P47945 62 aa8.54□□□□□ -1.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lce1bQ9D149 137 aa8.36□□□□□ -1.07
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fsip2A2ARZ3 6995 aa8.36□□□□□ -1.07
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa8.26□□□□□ -1.09
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm38119A0A0A6YX29 146 aa8.21□□□□□ -1.09
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2300003K06RikA2A4M0 262 aa8.09□□□□□ -1.11
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sprr2kO70562 68 aa8.08□□□□□ -1.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa7.95□□□□□ -1.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10272F7CZ33 110 aa7.93□□□□□ -1.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sprr2gO70558 76 aa7.9□□□□□ -1.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap4-7Q9D732 168 aa7.9□□□□□ -1.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sprr2dO70555 85 aa7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.3 ms