RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	ATG11	Q12527	1178 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	PET111	P08468	800 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	BIK1	P11709	440 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TY2A-C	P25383	438 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	LRG1	P35688	1017 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	POA1	P38218	177 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	VID24	P38263	362 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	MET28	P40573	187 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	REG1	Q00816	1014 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ACS1	Q01574	713 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YPS7	Q06325	596 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TCO89	Q08921	799 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	IOC2	Q12072	812 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TY3A-G	Q12173	290 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TY2A-B	Q12260	438 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TY3A-I	Q99219	290 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	DAP2	P18962	818 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	SPS22	P25380	463 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	DOA4	P32571	926 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	LTV1	P34078	463 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	REV7	P38927	245 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	GIP4	P39732	760 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	DOT5	P40553	215 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	CHS6	P40955	746 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	CEP3	P40969	608 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	GCV1	P48015	400 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	PNG1	Q02890	363 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ABZ2	Q03266	374 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	THI22	Q06490	572 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	THI21	Q08975	551 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	SWT1	Q12104	458 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YOR022C	Q12204	715 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	HOS1	Q12214	470 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	AVL9	Q12500	764 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RTG1	P32607	177 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	SEF1	P34228	1148 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	CST26	P38226	397 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RRM3	P38766	723 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	WSS1	P38838	269 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.49	□□□□□ -1.85	not detected
TOP1	YOL006C	AIM20	P40451	204 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	BUD8	P41698	603 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	AAD10	P47182	288 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	MLC1	P53141	149 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YGR111W	P53265	400 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RCM1	P53972	490 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ATG21	Q02887	496 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	MRPL1	Q04599	285 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	MSC3	Q05812	728 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ARR1	Q06596	294 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	STP4	Q07351	490 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	URA3	P03962	267 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	KRE6	P32486	720 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ALY1	P36117	915 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	MMS4	P38257	691 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YFL054C	P43549	646 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	VPS4	P52917	437 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	MTC3	P53077	123 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	LCL3	P53153	274 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	PEF1	P53238	335 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YNL050C	P53952	270 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	SMA1	Q02651	245 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	PEX19	Q07418	342 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	DCI1	Q08558	271 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.48	□□□□□ -1.85	not detected

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