RNA–Protein interactions for RNA: YNL171C

YNL171C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL171C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL171C	YNL171C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	DPB3	P27344	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	NPR3	P38742	1146 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	BI2	P03873	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	XRS2	P33301	854 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	HOT13	P36078	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	APD1	P38281	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	CIR1	P42940	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	TAM41	P53230	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	YNL058C	P53947	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	HRD3	Q05787	833 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	CYK3	Q07533	885 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	CIR2	Q08822	631 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	MTF2	P10849	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	APN1	P22936	367 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	URK1	P27515	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	NUP120	P35729	1037 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	MPS1	P54199	764 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	MBR1	P23493	339 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	YUR1	P26725	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	GSY2	P27472	705 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	RAD16	P31244	790 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	PSY4	P38193	441 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	ERC1	P38767	581 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	SAE2	P46946	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	IML2	P47031	731 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	UBX6	P47049	396 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	YGR079W	P53249	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	GTR1	Q00582	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	COX17	Q12287	69 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	TPK1	P06244	397 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
YNL171C	YNL171C	BEM3	P32873	1128 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	EXO84	P38261	753 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	IFA38	P38286	347 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	UME6	P39001	836 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	NPA3	P47122	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	ATP23	P53722	227 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	GTB1	Q04924	702 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	STP3	Q05937	343 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	ORM2	Q06144	216 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	IRC3	Q06683	689 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	COX1	P00401	534 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	YAT1	P80235	687 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	ATG23	Q06671	453 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	LAC1	P28496	418 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	BUD16	P39988	312 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	COG1	P53079	417 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	YML131W	Q03102	365 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	BSP1	Q06604	576 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	SWT1	Q12104	458 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	SPO16	P17122	198 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	SLC1	P33333	303 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	HES1	P35843	434 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	CTF18	P49956	741 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	TPO3	Q06451	622 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	GEP3	Q08622	556 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	PCD1	Q12524	340 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	PTC6	P25646	442 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	FTH1	P38310	465 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	DJP1	P40564	432 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	RAD34	Q06665	692 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL171C	YNL171C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 67.1 ms