RNA–Protein interactions for RNA: YKL039W

PTM1, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene PTM1, Length 1,572 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PTM1	YKL039W	YKL133C	P36066	463 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTM1	YKL039W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTM1	YKL039W	ATG36	P46983	293 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTM1	YKL039W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTM1	YKL039W	YBT1	P32386	1661 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTM1	YKL039W	NUP1	P20676	1076 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	QRI7	P43122	407 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	RAD33	Q04231	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	ATP4	P05626	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	VPS8	P39702	1274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	VPS64	Q03944	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	CYK3	Q07533	885 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	IML1	P47170	1584 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	CTT1	P06115	562 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	MSS18	P08593	268 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	BST1	P43571	1029 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	SAE2	P46946	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	TEP1	P53916	434 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	CRF1	Q04930	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	HRD3	Q05787	833 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	LCB4	Q12246	624 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	FRE7	Q12333	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	APN1	P22936	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	PTP2	P29461	750 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	MAM1	P40065	302 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	HIS6	P40545	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	UBP16	Q02863	499 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	AIM6	Q07716	390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	SIR1	P21691	654 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	APD1	P38281	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	COG2	P53271	262 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	ATP23	P53722	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	BSP1	Q06604	576 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	APM3	P38153	483 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	MTG2	P38860	518 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	LNP1	P38878	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	RAD26	P40352	1085 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	IRC3	Q06683	689 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	ICL2	Q12031	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	LTP1	P40347	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	LAS21	P40367	830 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	SPC72	P39723	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	YML053C	Q04978	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	ORM2	Q06144	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	NYV1	Q12255	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	VMR1	P38735	1592 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTM1	YKL039W	PIF1	P07271	859 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	IOC4	Q04213	475 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	PLM2	Q04383	521 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	HIM1	Q06674	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	POL3	P15436	1097 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	RIT1	P23796	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	BEM3	P32873	1128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	YHL041W	P38730	149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	ERC1	P38767	581 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	XBP1	P40489	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	CAB2	P40506	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	RAD34	Q06665	692 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	CIR1	P42940	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	NMD5	P46970	1048 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	PDE1	P22434	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	FTH1	P38310	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	YJR008W	P47085	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	IMA1	P53051	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	TAM41	P53230	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTM1	YKL039W	RSC9	Q03124	581 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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