RNA–Protein interactions for RNA: YKL008C

LAC1, Transcript of Ceramide synthase component, yeast

Gene LAC1, Length 1,257 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LAC1	YKL008C	MRPL36	P36531	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	EXO84	P38261	753 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	IFA38	P38286	347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	RAD26	P40352	1085 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	SMK1	P41808	388 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	ATP23	P53722	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	COQ11	Q05892	277 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	COX1	P00401	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	BI2	P03873	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	MTF2	P10849	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	BEM3	P32873	1128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	APD1	P38281	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	PSR2	Q07949	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	COX17	Q12287	69 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	FRE7	Q12333	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	APN1	P22936	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	CIR1	P42940	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	GTR1	Q00582	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	BSP1	Q06604	576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	PCD1	Q12524	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	MBR1	P23493	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	NPR3	P38742	1146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	BUD16	P39988	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	UBX6	P47049	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	GTB1	Q04924	702 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	RAD34	Q06665	692 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	SSM4	P40318	1319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	TPK1	P06244	397 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	LAC1	P28496	418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	PSY4	P38193	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	YAT1	P80235	687 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	RIM13	Q03792	727 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	ORM2	Q06144	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	BUD4	P47136	1447 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	RAD16	P31244	790 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	XRS2	P33301	854 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	NUP120	P35729	1037 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	FTH1	P38310	465 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	BNA1	P47096	177 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	COG1	P53079	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	YML122C	Q03207	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	TPO3	Q06451	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LAC1	YKL008C	MDS3	P53094	1487 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
LAC1	YKL008C	MDM10	P18409	493 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	MAK32	P23060	363 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	HES1	P35843	434 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	IML2	P47031	731 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	CTF18	P49956	741 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	YNL058C	P53947	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	SEG1	Q04279	960 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	TFC6	Q06339	672 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	IRC3	Q06683	689 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	PTC6	P25646	442 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	GSH1	P32477	678 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	UBP7	P40453	1071 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	YML131W	Q03102	365 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	TRM8	Q12009	286 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	SWT1	Q12104	458 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	UME6	P39001	836 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	ERV46	P39727	415 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	XBP1	P40489	647 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	DJP1	P40564	432 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	CIN1	P40987	1014 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16 ms