RNA–Protein interactions for RNA: YHR192W

LNP1, Transcript of Lunapark family member involved in ER network formation, yeast

Gene LNP1, Length 837 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LNP1	YHR192W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	SPE1	P08432	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	FBP1	P09201	348 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	SED4	P25365	1065 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	ADK2	P26364	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	UBP11	P36026	717 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	FTH1	P38310	465 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	SFB3	P38810	929 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	CHS7	P38843	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	GID8	P40208	455 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	CHA4	P43634	648 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	SGF73	P53165	657 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	JJJ1	P53863	590 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	TRS31	Q03337	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	RIM20	Q12033	661 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	NMD4	Q12129	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	PRE4	P30657	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	STB6	P36085	766 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	CDS1	P38221	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	YBR259W	P38338	688 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	RTS1	P38903	757 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	ASE1	P50275	885 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	VPS4	P52917	437 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	EOS1	P53938	366 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	ASM4	Q05166	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	ADY4	Q05955	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	CIR2	Q08822	631 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	SWM1	Q12379	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	CLB1	P24868	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	PUP2	P32379	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	GCS1	P35197	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	SWH1	P35845	1188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	ALY1	P36117	915 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	LTP1	P40347	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
LNP1	YHR192W	BIT61	P47041	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	AAD10	P47182	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	ASI2	P53895	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	NGL3	Q03210	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	VPS36	Q06696	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	ICL2	Q12031	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LNP1	YHR192W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
LNP1	YHR192W	MGM1	P32266	881 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	SMI1	P32566	505 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	SRO77	P38163	1010 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	TDP1	P38319	544 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	ECM1	P39715	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	YNL195C	P40168	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	ZIM17	P42844	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	GLO1	P50107	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	YGR066C	P53242	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	ADA2	Q02336	434 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	THI22	Q06490	572 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	TCO89	Q08921	799 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	NFI1	Q12216	726 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	POM34	Q12445	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	YLR415C	O13578	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	MTC7	P32633	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	SIC1	P38634	284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	SMF1	P38925	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	IDS2	P46958	469 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	GAD1	Q04792	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	AIM6	Q07716	390 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	TMA16	Q08687	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	TGL5	Q12043	749 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	SUL2	Q12325	893 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LNP1	YHR192W	GPR1	Q12361	961 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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