RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	LCB2	P40970	561 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	YGR021W	P53212	290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	TAM41	P53230	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	MAL13	P53338	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
CPR4	YCR069W	YNL146W	P53906	100 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	ARK1	P53974	638 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	NRG1	Q03125	231 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	MLH2	Q07980	695 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	ECM29	P38737	1868 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	RIF1	P29539	1916 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	YLR415C	O13578	112 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	MTF2	P10849	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	MAS2	P11914	482 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	FUB1	P25659	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SWI3	P32591	825 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	YBR053C	P38235	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	DAS1	P47005	663 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	BFA1	P47113	574 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	ATP25	Q03153	612 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	CIR2	Q08822	631 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	SUT2	Q12286	268 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR4	YCR069W	DPB3	P27344	201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	PAH1	P32567	862 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	SPC29	P33419	253 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	MTH1	P35198	433 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	BLI1	P35727	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	BYE1	P36106	594 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	YMC2	P38087	329 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	TCD1	P38756	429 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	NDC80	P40460	691 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	SHR5	P41912	237 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	SKP2	P42843	763 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	AMA1	P50082	593 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	ALT2	P52892	507 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	GND2	P53319	492 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	CRR1	Q05790	422 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	IRC10	Q08118	586 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	APC5	Q08683	685 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	CNS1	P33313	385 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	YEL1	P34225	687 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	YPT53	P36019	220 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	YHR054C	P38780	354 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	EFM4	P40516	257 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	HXT16	P47185	567 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	HOP2	P53187	214 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	UME1	Q03010	460 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	SKY1	Q03656	742 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	VAC14	Q06708	880 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	SPO12	P17123	173 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	GLN3	P18494	730 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	NFU1	P32860	256 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	XRS2	P33301	854 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	RPC25	P35718	212 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	SPC42	P36094	363 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	VID24	P38263	362 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	SIC1	P38634	284 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	YTA12	P40341	825 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	LAM5	P43560	674 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	YJL163C	P46996	555 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	CTR1	P49573	406 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	ORC5	P50874	479 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	BTN2	P53286	410 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	JJJ1	P53863	590 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64

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