RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BB014433Q8C5R5 389 aa8.91□□□□□ -0.98
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cdk2ap2Q9CPY4 127 aa8.91□□□□□ -0.98
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defb37Q7TMD2 62 aa8.9□□□□□ -0.98
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defa1P11477 93 aa8.89□□□□□ -0.99
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Elof1P60003 83 aa8.89□□□□□ -0.99
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lamtor3O88653 124 aa8.89□□□□□ -0.99
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BC048502Q80Y74 154 aa8.89□□□□□ -0.99
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 9530003J23RikQ8BM26 151 aa8.89□□□□□ -0.99
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igf1P05017 153 aa8.88□□□□□ -0.99
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defa4P28311 92 aa8.88□□□□□ -0.99
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm9508A0A1W2P7W0 230 aa8.87□□□□□ -0.99
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sprr1aQ62266 144 aa8.86□□□□□ -0.99
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv8-21A0A140T8P7 120 aa8.85□□□□□ -0.99
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ormdl1Q921I0 153 aa8.85□□□□□ -0.99
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ntn5Q3UQ22 452 aa8.84□□□□□ -0.99
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam168bQ80XQ8 194 aa8.84□□□□□ -0.99
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cystm1Q8K353 104 aa8.84□□□□□ -0.99
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A730071L15RikQ8C4X0 137 aa8.83□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Csmd3Q80T79 3707 aa8.83□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm7276Q3TYW4 209 aa8.82□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10308Q9CVR5 141 aa8.82□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv1-122A0A140T8M9 119 aa8.82□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pou2af1Q64693 256 aa8.82□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igsf10Q3V1M1 2594 aa8.81□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm11627A6PWP4 55 aa8.81□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem254aP0DN89 123 aa8.81□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem254bP0DN90 123 aa8.81□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem254cP0DN91 123 aa8.81□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10735Q3US96 136 aa8.81□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hist1h4aP62806 103 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P84750 121 aa8.81□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 MplkipQ9D011 178 aa8.8□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defa25Q5G864 92 aa8.8□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2310061N02RikQ9D6S9 174 aa8.8□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Apoc4Q61268 124 aa8.79□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rbm3O89086 153 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv3-12A0A140T8P0 119 aa8.78□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wfdc6bF6ULY1 148 aa8.78□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv2-5A0A0A6YY69 116 aa8.78□□□□□ -1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam19a1Q7TPG8 133 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dmac1Q9CQ00 111 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ubl5Q9EPV8 73 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TnxbO35452 4006 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Megf8P60882 2789 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Inafm2A0A1L1STD6 152 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 7530416G11RikJ3QJX6 159 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BaalcQ8VHV1 145 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv8-28A0A0G2JE47 121 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm17349F7BGH6 99 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vpreb2P13373 142 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A0A286YE02 88 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 B9d2Q3UK10 175 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem243B2RVB9 118 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Obox2E9PXV9 151 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PkigO70139 76 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam19a5Q91WE9 132 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AW011738F6S7Q2 159 aa8.74□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Huwe1Q7TMY8 4377 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv3-2A0A075B5P0 119 aa8.73□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm28539A0A087WSL9 92 aa8.73□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm17689B3GLJ4 109 aa8.73□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prol1E9PYQ4 312 aa8.73□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 D130052B06RikQ3UW13 202 aa8.73□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pde6gP09174 87 aa8.73□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dync2h1Q45VK7 4306 aa8.72□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TgO08710 2766 aa8.72□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Stab2Q8R4U0 2559 aa8.71□□□□□ -1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Naa38Q9D2U5 125 aa8.7□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam229bQ8CF36 80 aa8.7□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm3618D3Z4P5 127 aa8.69□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ScxQ64124 207 aa8.69□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defb40Q70KL2 73 aa8.69□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A830005F24RikQ8BRT5 167 aa8.69□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm2916Q9D9B9 127 aa8.69□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Muc6Q80T03 2850 aa8.69□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm11011D3Z3L9 86 aa8.69□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SmcpP15265 143 aa8.68□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A930002H24RikQ8C8Y3 163 aa8.68□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv1-110A0A0B4J1I0 119 aa8.67□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defa7P50705 93 aa8.67□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defa23Q5G866 93 aa8.67□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A330070K13RikQ8CA53 115 aa8.67□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv2-2A0A075B5P8 116 aa8.67□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P01821 116 aa8.67□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cox6a2P43023 97 aa8.66□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sfta2E9PXB6 77 aa8.66□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm20726G3UX18 150 aa8.66□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P06320 134 aa8.66□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tenm2Q9WTS5 2764 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm4707V9GXN5 68 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dnah11E9Q7N9 4488 aa8.65□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defa27F2Z403 93 aa8.65□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vpreb1P13372 142 aa8.65□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10837Q3UTT8 145 aa8.65□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Serp2Q6TAW2 65 aa8.65□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 4930518I15RikQ3V2W7 57 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SycnQ8VCK7 134 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sprr2jO70561 109 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PscaP57096 123 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pkd1l1Q8R526 2615 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.3 ms