RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tal2Q62282 108 aa10.86□□□□□ -0.67
Casq1-201ENSMUST00000003554 Isg15Q64339 161 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
Casq1-201ENSMUST00000003554 Defa22Q8C1N8 93 aa10.86□□□□□ -0.67
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfand2aQ9JII7 171 aa10.86□□□□□ -0.67
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pkd1l1Q8R526 2615 aa10.86□□□□□ -0.67
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rmi2Q3UPE3 149 aa10.86□□□□□ -0.67
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prelid3aQ8VE85 172 aa10.86□□□□□ -0.67
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ighv2-9-1A0A075B697 116 aa10.84□□□□□ -0.67
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dnah7bL7N1Y0 4068 aa10.84□□□□□ -0.67
Casq1-201ENSMUST00000003554 Iglc1A0A0G2JE99 106 aa10.84□□□□□ -0.67
Casq1-201ENSMUST00000003554 4930432M17RikQ3V0W9 174 aa10.84□□□□□ -0.67
Casq1-201ENSMUST00000003554 MrapQ9D159 127 aa10.84□□□□□ -0.67
Casq1-201ENSMUST00000003554 Muc6Q80T03 2850 aa10.83□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Megf8P60882 2789 aa10.83□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn1r197Q8R265 298 aa10.82□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 4930442H23RikQ9D5G7 103 aa10.82□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm11213A0A1B0GR83 88 aa10.81□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Smim13E9Q942 88 aa10.81□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Q9DAA3 117 aa10.81□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ighv13-2A0A0A6YWN3 119 aa10.81□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Bsph2Q0Q236 131 aa10.81□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tax1bp3Q9DBG9 124 aa10.81□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trav4-3A0A0B4J1K1 110 aa10.8□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 C920008G01RikA0A0B4J1N1 112 aa10.8□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Insl3O09107 122 aa10.8□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Defb50Q6TU36 73 aa10.8□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 SpinklQ8CEK3 90 aa10.8□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem238A9JSM3 176 aa10.79□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm26727M0QWT1 121 aa10.79□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 G0s2Q61585 103 aa10.79□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prss58Q8BW11 241 aa10.79□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ighv1-61P01749 117 aa10.77□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Defa9P50707 93 aa10.77□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Defa15P50713 93 aa10.77□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 2310061N02RikQ9D6S9 174 aa10.77□□□□□ -0.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Stab2Q8R4U0 2559 aa10.77□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 Morn5Q9DAI9 170 aa10.77□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 P01755 137 aa10.76□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 PrkdcP97313 4128 aa10.75□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cited1P97769 203 aa10.74□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 Srsf9Q9D0B0 222 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trav9d-4A0A0G2JG37 103 aa10.74□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 P01896 185 aa10.74□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 BtcQ05928 177 aa10.74□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 S100a8P27005 89 aa10.73□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ube2v1Q9CZY3 147 aa10.73□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 P01843 105 aa10.72□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm16485Q8C4B7 115 aa10.72□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gemin7Q9CWY4 129 aa10.72□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm17509Q9CZ61 145 aa10.72□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 1700010B08RikQ9DAI7 102 aa10.72□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 Q9DAQ5 155 aa10.72□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 Timm17bQ9Z0V7 172 aa10.72□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ighv1-56A0A0A6YXG2 117 aa10.72□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm6812B1AXU1 112 aa10.72□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 4930544G11RikQ9CR99 193 aa10.72□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tenm2Q9WTS5 2764 aa10.71□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 FasnP19096 2504 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 B230359F08RikA0A0B4J1K3 109 aa10.71□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm9507D3Z5T3 223 aa10.71□□□□□ -0.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 1700011M02RikB1AX35 88 aa10.7□□□□□ -0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem86bQ497J1 226 aa10.7□□□□□ -0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cks1bP61025 79 aa10.7□□□□□ -0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm5617Q91VN2 117 aa10.7□□□□□ -0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sostdc1Q9CQN4 206 aa10.7□□□□□ -0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fras1Q80T14 4010 aa10.7□□□□□ -0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trav4d-3A0A075B625 110 aa10.69□□□□□ -0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm11020F6ZGD5 61 aa10.69□□□□□ -0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rpl24Q8BP67 157 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 C530025M09RikF6RGA8 229 aa10.68□□□□□ -0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm10251J3QPM5 127 aa10.68□□□□□ -0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Igkv8-24A0A140T8P5 121 aa10.68□□□□□ -0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm9918Q8BUR5 174 aa10.68□□□□□ -0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Glrp1E9Q9S8 174 aa10.67□□□□□ -0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 119 aa10.66□□□□□ -0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ndufa12Q7TMF3 145 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 4930415O20RikQ8CDT5 131 aa10.65□□□□□ -0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cox7cP17665 63 aa10.64□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mzt1Q8BUR9 78 aa10.64□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ighv2-9A0A075B5Q5 116 aa10.63□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm6793B2RXM2 351 aa10.63□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Smr3aQ61900 147 aa10.63□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pfn2Q9JJV2 140 aa10.63□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 PlecQ9QXS1 4691 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pgpep1Q9ESW8 209 aa10.63□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 CckP09240 115 aa10.62□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mc5rP41149 325 aa10.62□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm10577Q3UDV9 132 aa10.62□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm867A0A1W2P7T4 151 aa10.61□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tac4Q99N14 128 aa10.61□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 4930556J24RikQ9D4U7 146 aa10.61□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tspan13Q9D8C2 204 aa10.61□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rab37Q9JKM7 223 aa10.61□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 MturnQ8CGA4 131 aa10.61□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cox7b2Q9D2H1 82 aa10.61□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slamf6Q9ET39 351 aa10.61□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 A730009L09RikA0A1B0GS82 72 aa10.6□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Defa16P50714 93 aa10.59□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cops9Q3U898 57 aa10.59□□□□□ -0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dppa2Q9CWH0 301 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.9 ms