Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0V7

Timm17b, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm17bQ9Z0V7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Timm17bQ9Z0V7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Timm17bQ9Z0V7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Timm17bQ9Z0V7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Timm17bQ9Z0V7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Timm17bQ9Z0V7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Timm17bQ9Z0V7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Timm17bQ9Z0V7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm17bQ9Z0V7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm17bQ9Z0V7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Timm17bQ9Z0V7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Timm17bQ9Z0V7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Timm17bQ9Z0V7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Timm17bQ9Z0V7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Timm17bQ9Z0V7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Timm17bQ9Z0V7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Timm17bQ9Z0V7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Timm17bQ9Z0V7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Timm17bQ9Z0V7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Timm17bQ9Z0V7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Timm17bQ9Z0V7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Timm17bQ9Z0V7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Timm17bQ9Z0V7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Timm17bQ9Z0V7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Timm17bQ9Z0V7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Timm17bQ9Z0V7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timm17bQ9Z0V7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Timm17bQ9Z0V7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm17bQ9Z0V7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Timm17bQ9Z0V7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Timm17bQ9Z0V7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Timm17bQ9Z0V7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Timm17bQ9Z0V7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Timm17bQ9Z0V7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Timm17bQ9Z0V7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Timm17bQ9Z0V7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Timm17bQ9Z0V7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Timm17bQ9Z0V7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Timm17bQ9Z0V7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Timm17bQ9Z0V7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Timm17bQ9Z0V7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Timm17bQ9Z0V7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Timm17bQ9Z0V7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Timm17bQ9Z0V7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Timm17bQ9Z0V7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Timm17bQ9Z0V7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Timm17bQ9Z0V7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Timm17bQ9Z0V7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Timm17bQ9Z0V7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Timm17bQ9Z0V7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Timm17bQ9Z0V7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Timm17bQ9Z0V7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Timm17bQ9Z0V7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Timm17bQ9Z0V7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Timm17bQ9Z0V7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Timm17bQ9Z0V7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Timm17bQ9Z0V7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Timm17bQ9Z0V7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Timm17bQ9Z0V7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Timm17bQ9Z0V7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm17bQ9Z0V7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm17bQ9Z0V7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm17bQ9Z0V7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm17bQ9Z0V7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm17bQ9Z0V7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timm17bQ9Z0V7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm17bQ9Z0V7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timm17bQ9Z0V7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Timm17bQ9Z0V7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm17bQ9Z0V7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timm17bQ9Z0V7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Timm17bQ9Z0V7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Timm17bQ9Z0V7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Timm17bQ9Z0V7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Timm17bQ9Z0V7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Timm17bQ9Z0V7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Timm17bQ9Z0V7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Timm17bQ9Z0V7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timm17bQ9Z0V7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Timm17bQ9Z0V7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Timm17bQ9Z0V7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Timm17bQ9Z0V7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Timm17bQ9Z0V7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm17bQ9Z0V7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm17bQ9Z0V7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm17bQ9Z0V7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Timm17bQ9Z0V7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Timm17bQ9Z0V7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Timm17bQ9Z0V7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm17bQ9Z0V7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm17bQ9Z0V7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm17bQ9Z0V7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm17bQ9Z0V7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm17bQ9Z0V7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Timm17bQ9Z0V7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Timm17bQ9Z0V7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Timm17bQ9Z0V7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Timm17bQ9Z0V7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Timm17bQ9Z0V7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm17bQ9Z0V7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms