RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa33.97■■■■□ 3.03
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Abcc8B2RUS7 1588 aa32.53■■■□□ 2.8
Casq1-201ENSMUST00000003554 ScribQ80U72 1612 aa30.86■■■□□ 2.53
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rhox8Q6VSS7 320 aa30.25■■■□□ 2.43
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dcaf1Q80TR8 1506 aa30.18■■■□□ 2.42
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kdm5dQ62240 1548 aa30.04■■■□□ 2.4
Casq1-201ENSMUST00000003554 NacadQ5SWP3 1504 aa29.92■■■□□ 2.38
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa29.68■■■□□ 2.34
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccdc180J3QNE4 1664 aa29.41■■■□□ 2.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sycp2Q9CUU3 1500 aa29.32■■■□□ 2.28
Casq1-201ENSMUST00000003554 Baz1aO88379 1555 aa29.31■■■□□ 2.28
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rtl1Q7M732 1744 aa29.14■■■□□ 2.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Crybg2B7ZCC2 1516 aa28.97■■■□□ 2.23
Casq1-201ENSMUST00000003554 BicraF8VPZ9 1578 aa28.8■■■□□ 2.2
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Smarca2Q6DIC0 1577 aa28.57■■■□□ 2.16
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa28.18■■■□□ 2.1
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa28.1■■■□□ 2.09
Casq1-201ENSMUST00000003554 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
Casq1-201ENSMUST00000003554 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trim41Q5NCC3 630 aa27.71■■■□□ 2.03
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Synj1Q8CHC4 1574 aa27.69■■■□□ 2.02
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa27.56■■■□□ 2
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Ercc6F8VPZ5 1481 aa27.16■■□□□ 1.94
Casq1-201ENSMUST00000003554 Golga3P55937 1487 aa27.16■■□□□ 1.94
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Frmpd1A2AKB4 1549 aa27.14■■□□□ 1.93
Casq1-201ENSMUST00000003554 Top2bQ64511 1612 aa27.06■■□□□ 1.92
Casq1-201ENSMUST00000003554 HrcG5E8J6 738 aa27.06■■□□□ 1.92
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cngb1E1AZ71 1325 aa27.05■■□□□ 1.92
Casq1-201ENSMUST00000003554 Unc13aQ4KUS2 1712 aa26.91■■□□□ 1.9
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa26.82■■□□□ 1.88
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa26.73■■□□□ 1.87
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam135aQ6NS59 1506 aa26.73■■□□□ 1.87
Casq1-201ENSMUST00000003554 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
Casq1-201ENSMUST00000003554 Chic1Q8CBW7 227 aa26.66■■□□□ 1.86
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cep164Q5DU05 1446 aa26.65■■□□□ 1.86
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fmn1Q05860 1466 aa26.65■■□□□ 1.86
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa26.6■■□□□ 1.85
Casq1-201ENSMUST00000003554 TnnQ80Z71 1560 aa26.59■■□□□ 1.85
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lamc3Q9R0B6 1581 aa26.58■■□□□ 1.85
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kif15Q6P9L6 1387 aa26.46■■□□□ 1.83
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ubl4bQ9CQ84 188 aa26.42■■□□□ 1.82
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Baz1bQ9Z277 1479 aa26.3■■□□□ 1.8
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cux2P70298 1426 aa26.24■■□□□ 1.79
Casq1-201ENSMUST00000003554 Camsap1A2AHC3 1581 aa26.22■■□□□ 1.79
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gab3Q8BSM5 595 aa26.18■■□□□ 1.78
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccdc18Q640L5 1455 aa26.12■■□□□ 1.77
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mrc2Q64449 1479 aa26.1■■□□□ 1.77
Casq1-201ENSMUST00000003554 Il27Q8K3I6 234 aa26.08■■□□□ 1.77
Casq1-201ENSMUST00000003554 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa25.97■■□□□ 1.75
Casq1-201ENSMUST00000003554 Grin2bQ01097 1482 aa25.94■■□□□ 1.74
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kif21aQ9QXL2 1672 aa25.89■■□□□ 1.74
Casq1-201ENSMUST00000003554 NrkQ9R0G8 1455 aa25.88■■□□□ 1.73
Casq1-201ENSMUST00000003554 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
Casq1-201ENSMUST00000003554 PtprkP35822 1457 aa25.86■■□□□ 1.73
Casq1-201ENSMUST00000003554 Shroom4Q1W617 1475 aa25.83■■□□□ 1.73
Casq1-201ENSMUST00000003554 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cep162Q6ZQ06 1403 aa25.76■■□□□ 1.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Npm2Q80W85 207 aa25.74■■□□□ 1.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Duox2A2AQ99 1517 aa25.71■■□□□ 1.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Efcab5A0JP43 1406 aa25.67■■□□□ 1.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Crocc2F6XLV1 1638 aa25.67■■□□□ 1.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Arhgap35Q91YM2 1499 aa25.62■■□□□ 1.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 Samd9lQ69Z37 1561 aa25.58■■□□□ 1.69
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa25.53■■□□□ 1.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa25.53■■□□□ 1.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Map3k1P53349 1493 aa25.51■■□□□ 1.68
Casq1-201ENSMUST00000003554 Myt1lP97500 1187 aa25.5■■□□□ 1.67
Casq1-201ENSMUST00000003554 Plb1Q3TTY0 1478 aa25.5■■□□□ 1.67
Casq1-201ENSMUST00000003554 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rad54l2Q99NG0 1466 aa25.38■■□□□ 1.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Clip1Q922J3 1391 aa25.32■■□□□ 1.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Disp1Q3TDN0 1521 aa25.29■■□□□ 1.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ift140E9PY46 1464 aa25.29■■□□□ 1.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Magi3Q9EQJ9 1476 aa25.27■■□□□ 1.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Carmil1Q6EDY6 1374 aa25.27■■□□□ 1.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Setd1bQ8CFT2 1985 aa25.27■■□□□ 1.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pla2r1Q62028 1487 aa25.23■■□□□ 1.63
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
Casq1-201ENSMUST00000003554 Grin2aP35436 1464 aa25.21■■□□□ 1.63
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
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