Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN4

Sostdc1, Sclerostin domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sostdc1Q9CQN4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sostdc1Q9CQN4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sostdc1Q9CQN4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sostdc1Q9CQN4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sostdc1Q9CQN4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sostdc1Q9CQN4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sostdc1Q9CQN4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sostdc1Q9CQN4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sostdc1Q9CQN4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sostdc1Q9CQN4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sostdc1Q9CQN4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sostdc1Q9CQN4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sostdc1Q9CQN4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sostdc1Q9CQN4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sostdc1Q9CQN4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sostdc1Q9CQN4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sostdc1Q9CQN4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sostdc1Q9CQN4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sostdc1Q9CQN4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Sostdc1Q9CQN4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sostdc1Q9CQN4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sostdc1Q9CQN4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sostdc1Q9CQN4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sostdc1Q9CQN4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sostdc1Q9CQN4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sostdc1Q9CQN4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sostdc1Q9CQN4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sostdc1Q9CQN4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sostdc1Q9CQN4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sostdc1Q9CQN4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sostdc1Q9CQN4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sostdc1Q9CQN4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sostdc1Q9CQN4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sostdc1Q9CQN4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sostdc1Q9CQN4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sostdc1Q9CQN4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sostdc1Q9CQN4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sostdc1Q9CQN4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sostdc1Q9CQN4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sostdc1Q9CQN4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sostdc1Q9CQN4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sostdc1Q9CQN4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sostdc1Q9CQN4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sostdc1Q9CQN4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sostdc1Q9CQN4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sostdc1Q9CQN4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sostdc1Q9CQN4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sostdc1Q9CQN4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sostdc1Q9CQN4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sostdc1Q9CQN4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sostdc1Q9CQN4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sostdc1Q9CQN4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sostdc1Q9CQN4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sostdc1Q9CQN4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sostdc1Q9CQN4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sostdc1Q9CQN4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sostdc1Q9CQN4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sostdc1Q9CQN4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sostdc1Q9CQN4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sostdc1Q9CQN4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sostdc1Q9CQN4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sostdc1Q9CQN4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sostdc1Q9CQN4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sostdc1Q9CQN4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sostdc1Q9CQN4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sostdc1Q9CQN4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sostdc1Q9CQN4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sostdc1Q9CQN4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sostdc1Q9CQN4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sostdc1Q9CQN4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sostdc1Q9CQN4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sostdc1Q9CQN4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sostdc1Q9CQN4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sostdc1Q9CQN4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sostdc1Q9CQN4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sostdc1Q9CQN4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sostdc1Q9CQN4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sostdc1Q9CQN4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sostdc1Q9CQN4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sostdc1Q9CQN4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sostdc1Q9CQN4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sostdc1Q9CQN4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sostdc1Q9CQN4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sostdc1Q9CQN4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sostdc1Q9CQN4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sostdc1Q9CQN4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sostdc1Q9CQN4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sostdc1Q9CQN4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sostdc1Q9CQN4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sostdc1Q9CQN4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sostdc1Q9CQN4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sostdc1Q9CQN4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sostdc1Q9CQN4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sostdc1Q9CQN4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sostdc1Q9CQN4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sostdc1Q9CQN4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sostdc1Q9CQN4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sostdc1Q9CQN4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sostdc1Q9CQN4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sostdc1Q9CQN4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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