Protein–RNA interactions for Protein: B1AXU1

Gm6812, MCG15151, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6812B1AXU1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm6812B1AXU1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm6812B1AXU1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm6812B1AXU1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6812B1AXU1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6812B1AXU1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6812B1AXU1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6812B1AXU1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6812B1AXU1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm6812B1AXU1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6812B1AXU1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6812B1AXU1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6812B1AXU1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6812B1AXU1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm6812B1AXU1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm6812B1AXU1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6812B1AXU1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm6812B1AXU1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm6812B1AXU1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6812B1AXU1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm6812B1AXU1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm6812B1AXU1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm6812B1AXU1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm6812B1AXU1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm6812B1AXU1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm6812B1AXU1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm6812B1AXU1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm6812B1AXU1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6812B1AXU1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm6812B1AXU1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6812B1AXU1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6812B1AXU1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6812B1AXU1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6812B1AXU1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm6812B1AXU1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm6812B1AXU1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm6812B1AXU1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm6812B1AXU1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm6812B1AXU1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm6812B1AXU1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm6812B1AXU1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm6812B1AXU1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm6812B1AXU1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm6812B1AXU1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm6812B1AXU1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6812B1AXU1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6812B1AXU1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6812B1AXU1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm6812B1AXU1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm6812B1AXU1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm6812B1AXU1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gm6812B1AXU1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm6812B1AXU1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm6812B1AXU1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm6812B1AXU1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm6812B1AXU1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm6812B1AXU1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm6812B1AXU1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm6812B1AXU1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm6812B1AXU1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm6812B1AXU1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm6812B1AXU1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm6812B1AXU1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm6812B1AXU1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm6812B1AXU1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm6812B1AXU1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm6812B1AXU1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm6812B1AXU1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm6812B1AXU1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm6812B1AXU1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm6812B1AXU1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm6812B1AXU1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm6812B1AXU1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm6812B1AXU1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm6812B1AXU1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm6812B1AXU1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm6812B1AXU1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm6812B1AXU1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm6812B1AXU1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm6812B1AXU1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm6812B1AXU1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm6812B1AXU1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm6812B1AXU1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm6812B1AXU1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm6812B1AXU1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm6812B1AXU1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm6812B1AXU1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm6812B1AXU1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm6812B1AXU1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm6812B1AXU1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm6812B1AXU1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm6812B1AXU1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm6812B1AXU1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm6812B1AXU1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm6812B1AXU1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm6812B1AXU1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm6812B1AXU1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm6812B1AXU1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm6812B1AXU1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm6812B1AXU1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms