RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	PCK1	P10963	549 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	DMC1	P25453	334 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	TRK2	P28584	889 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	SPC110	P32380	944 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	BCK2	P33306	851 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	UBP11	P36026	717 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	COS111	P38308	924 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YAR028W	P39548	234 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	LEM3	P42838	414 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	BST1	P43571	1029 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	HOP2	P53187	214 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	GCR2	Q01722	534 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	MAK10	Q02197	733 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	INP2	Q03824	705 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YLL058W	Q12198	575 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	ISN1	Q99312	450 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	SRB2	P34162	210 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	GPT2	P36148	743 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	FLR1	P38124	548 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	NPP2	P39997	493 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RCO1	Q04779	684 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	AAD4	Q07747	329 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	SOG2	Q08817	791 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	AFI1	Q99222	893 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	DNA2	P38859	1522 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	SFA1	P32771	386 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	MRE11	P32829	692 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	SPT23	P35210	1082 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	UGA2	P38067	497 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	UBP13	P38187	747 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YSW1	P38280	609 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	PEX32	P38292	413 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RRT14	P40470	206 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YIL089W	P40500	205 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ALT2	P52892	507 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	COG1	P53079	417 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	MDR1	P53258	950 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	DSE4	P53753	1117 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	GIM3	P53900	129 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ROY1	Q04847	553 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YDL129W	Q07555	291 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	CTF3	Q12748	733 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	GAL7	P08431	366 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ERV1	P27882	189 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	SEC61	P32915	480 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	REG2	P38232	338 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YHL017W	P38745	532 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	GPB2	P39717	880 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	CAB2	P40506	365 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YMR210W	Q03649	449 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YDR344C	Q05510	147 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	CRD1	Q07560	283 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	GPB1	Q08886	897 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	VPS54	Q12071	889 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	PRC1	P00729	532 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	CDC4	P07834	779 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	AFT1	P22149	690 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	VPS3	P23643	1011 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	HMX1	P32339	317 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	GIC1	P38785	314 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RGI2	P40188	164 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YJL070C	P40361	888 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	INA22	P40576	216 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	GLO1	P50107	326 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	SNZ1	Q03148	297 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	SRT1	Q03175	343 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ECM18	Q04623	453 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YPR196W	Q06595	470 aa		3.5	□□□□□ -1.85

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47.4 ms