RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W THI21Q08975 551 aa9.37□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W APC11Q12157 165 aa9.37□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W YDR061WQ12298 539 aa9.37□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W AFI1Q99222 893 aa9.37□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W MIS1P09440 975 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W RED1P14291 827 aa9.36□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W TUP1P16649 713 aa9.36□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W SLD2P34252 453 aa9.36□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W POB3Q04636 552 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W YDR222WQ04925 415 aa9.36□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W YOL073CQ08232 322 aa9.36□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W SKM1Q12469 655 aa9.36□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W MNE1P24720 663 aa9.35□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W AIM26P32858 118 aa9.35□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W PSY4P38193 441 aa9.35□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W YEL028WP39989 153 aa9.35□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data9.35□□□□□ -0.91not detected
YLR349WYLR349W TMA16Q08687 178 aa9.35□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W APL5Q08951 932 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W MTF2P10849 440 aa9.34□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W PMA2P19657 947 aa9.34□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W IRS4P36115 615 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W SHM1P37292 490 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W TMN3P40071 706 aa9.34□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W YIR014WP40570 242 aa9.34□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W RPS10BP46784 105 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data9.34□□□□□ -0.91not detected
YLR349WYLR349W REG1Q00816 1014 aa9.34□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W YDR131CQ03899 556 aa9.34□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W PPN1Q04119 674 aa9.34□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W GRX8Q05926 109 aa9.34□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
YLR349WYLR349W YPK1P12688 680 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W CLC1P17891 233 aa9.33□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W SPC110P32380 944 aa9.33□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W UBS1P38290 277 aa9.33□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W MMM1P41800 426 aa9.33□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W RRT5P43607 289 aa9.33□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W SET2P46995 733 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W SPC105P53148 917 aa9.33□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W KAP95Q06142 861 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W SWC7Q06707 132 aa9.33□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data9.33□□□□□ -0.92not detected
YLR349WYLR349W YOL036WQ08206 761 aa9.33□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W YKR104WP0CE69 306 aa9.32□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W SCH9P11792 824 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W PPH21P23594 369 aa9.32□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W RBK1P25332 333 aa9.32□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W SNT1P25357 1226 aa9.32□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W PAT1P25644 796 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W HXT3P32466 567 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W RRM3P38766 723 aa9.32□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W RRN7P40992 514 aa9.32□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W DLD2P46681 530 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data9.32□□□□□ -0.92not detected
YLR349WYLR349W HXT16P47185 567 aa9.32□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W TIM13P53299 105 aa9.32□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W IPI3P53877 555 aa9.32□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W HXT15P54854 567 aa9.32□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W MSH6Q03834 1242 aa9.32□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W OCA6Q12454 224 aa9.32□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W TUB1P09733 447 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W FUI1P38196 639 aa9.31□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W SWC5P38326 303 aa9.31□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W CFD1P40558 293 aa9.31□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W YGR111WP53265 400 aa9.31□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W TRE2Q08693 809 aa9.31□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W GLN4P13188 809 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W AAT2P23542 418 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W BEM1P29366 551 aa9.3□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W TFC3P34111 1160 aa9.3□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W SCD5P34758 872 aa9.3□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W LRP1P38801 184 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W ATM1P40416 690 aa9.3□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W CSN12P47130 423 aa9.3□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W CDC55Q00362 526 aa9.3□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W ENT2Q05785 613 aa9.3□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W YDL073WQ07454 984 aa9.3□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W CMS1Q07897 291 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W CIR2Q08822 631 aa9.3□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W INH1P01097 85 aa9.29□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W TRX1P22217 103 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W YKL050CP35736 922 aa9.29□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W CEM1P39525 442 aa9.29□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W PTI1P39927 425 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W KHA1P40309 873 aa9.29□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W ARG7Q04728 441 aa9.29□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W YOR238WQ08634 303 aa9.29□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W GPM3Q12326 303 aa9.29□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W SEC39Q12745 709 aa9.29□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W IZH4Q99393 312 aa9.29□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W GAL11P19659 1081 aa9.28□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W MSH3P25336 1018 aa9.28□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W SEC65P29478 273 aa9.28□□□□□ -0.92
YLR349WYLR349W SPR1P32603 445 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.9 ms