RNA–Protein interactions for RNA: YDL030W

PRP9, Transcript of Subunit of the SF3a splicing factor complex, yeast

Gene PRP9, Length 1,593 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRP9	YDL030W	TDA10	P42938	290 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	PCL8	Q08966	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	IDS2	P46958	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	KOG1	P38873	1557 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	VPS15	P22219	1454 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	SNM1	P40993	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	NET1	P47035	1189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	GSY2	P27472	705 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	VFA1	P40080	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	YIR014W	P40570	242 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	BEM3	P32873	1128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	MTG2	P38860	518 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	LNP1	P38878	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	MLP2	P40457	1679 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	CTT1	P06115	562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	GDA1	P32621	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	LAS21	P40367	830 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	ASK10	P48361	1146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	GLO1	P50107	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	YNL092W	P53934	400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	YNL034W	P53963	612 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	ENT2	Q05785	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	BSP1	Q06604	576 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	FRE7	Q12333	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	IRC20	Q06554	1556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	BI2	P03873	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	ADH4	P10127	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	ROX1	P25042	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	MAM1	P40065	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	COG2	P53271	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	TRS31	Q03337	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	SND1	Q04007	877 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	CDC45	Q08032	650 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRP9	YDL030W	YLF2	P38746	405 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	SNO3	P43544	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	BST1	P43571	1029 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	SAE2	P46946	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	NMD5	P46970	1048 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	RAD33	Q04231	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	ICT1	Q12385	394 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	ATG2	P53855	1592 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	SWD1	P39706	426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	POL31	P46957	487 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	ACS1	Q01574	713 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	UBP16	Q02863	499 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	YML119W	Q03208	357 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	HRD3	Q05787	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	CYK3	Q07533	885 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	CRD1	Q07560	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	YCR061W	P25639	631 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	NIC96	P34077	839 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	IMA5	P40884	581 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	YNL058C	P53947	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	TGL2	P54857	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	SEC5	P89102	971 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	CAT8	P39113	1433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	AMD2	P22580	549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	TOM20	P35180	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	RAD26	P40352	1085 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	PEX8	P53248	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	STP1	Q00947	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	AAT1	Q01802	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	VPS64	Q03944	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	AAD4	Q07747	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	YAP7	Q08182	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	ARP7	Q12406	477 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	MPD2	Q99316	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	DNF1	P32660	1571 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	TMT1	P32643	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	CIR1	P42940	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	CRF1	Q04930	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP9	YDL030W	TPO3	Q06451	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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