RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01843 105 aa5.05□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P06334 169 aa5.05□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P18527 97 aa5.05□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Defb30Q30KN4 75 aa5.05□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nbl1Q61477 178 aa5.05□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tal2Q62282 108 aa5.05□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 E130116L18RikQ8BMV6 101 aa5.05□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 A130051J06RikQ8CAU1 227 aa5.05□□□□□ -1.6
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ighv1-53A0A075B5W3 117 aa5.05□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv4-71A0A0G2JEH0 117 aa5.05□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Brd3osA0A1B0GRB6 84 aa5.05□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Defa37K9J724 93 aa5.05□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Egr1P08046 533 aa5.05□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smim1P0C8K7 78 aa5.05□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Defa5P28312 93 aa5.05□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spink13Q3UTS8 97 aa5.05□□□□□ -1.6
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pla2g2dQ9WVF6 144 aa5.05□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ApomQ9Z1R3 190 aa5.05□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ighv1-22A0A075B5U7 117 aa5.04□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TshbP12656 138 aa5.04□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cks1brtQ3UNC9 96 aa5.04□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ighv3-1A0A075B5S6 116 aa5.04□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01724 129 aa5.04□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01727 129 aa5.04□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ighv1-62-3P01754 117 aa5.04□□□□□ -1.6
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sigmar1O55242 223 aa5.03□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01725 110 aa5.03□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trav7-2Q5R1I3 112 aa5.03□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr312Q7TRZ9 308 aa5.03□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chac1Q8R3J5 223 aa5.03□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gkn1Q9CR36 201 aa5.03□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RhohQ9D3G9 191 aa5.03□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rbmxl2Q9DAE2 385 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ighv3-4A0A0A6YXF1 117 aa5.03□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdx4Q07424 282 aa5.03□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hif1anQ8BLR9 349 aa5.03□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Parm1Q923D3 296 aa5.03□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sptan1P16546 2472 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm44965A0A0N4SVR3 59 aa5.03□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Esp4A8R0T8 117 aa5.03□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mustn1Q99JI1 82 aa5.03□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tnfrsf23Q9ER63 176 aa5.03□□□□□ -1.6
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ubr5Q80TP3 2792 aa5.03□□□□□ -1.6
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5819E9PZ96 154 aa5.02□□□□□ -1.61
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 S100a4P07091 101 aa5.02□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ang5Q5GAN1 145 aa5.02□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FshbQ60687 130 aa5.02□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp248Q640N4 576 aa5.02□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prss41Q920S2 322 aa5.02□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrpl36Q99N90 102 aa5.02□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q9CX63 252 aa5.02□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Qrich2A0A140LIY9 2337 aa5.02□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm12845A0A0N4SUM5 588 aa5.02□□□□□ -1.61
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 PolP10400 120 aa5.02□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sumo2P61957 95 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndufa4Q62425 82 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Psmb11Q8BG41 302 aa5.02□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnajb12Q9QYI4 376 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hcfc1Q61191 2045 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Csmd2V9GX34 3611 aa5.02□□□□□ -1.61
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd69P37217 199 aa5.02□□□□□ -1.61
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Defa15P50713 93 aa5.02□□□□□ -1.61
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prss29Q99MS4 279 aa5.02□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nit2Q9JHW2 276 aa5.02□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HilpdaQ9JLS0 64 aa5.02□□□□□ -1.61
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Socs3O35718 225 aa5.01□□□□□ -1.61
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Csn3P06796 181 aa5.01□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Odf1Q61999 247 aa5.01□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AamdcQ8R0P4 122 aa5.01□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem14cQ9CQN6 114 aa5.01□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ighv1-9A0A0A6YW37 117 aa5.01□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv4-70A0A0B4J1I5 116 aa5.01□□□□□ -1.61
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Edn3P48299 214 aa5.01□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tex26Q0VB26 296 aa5.01□□□□□ -1.61
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21370Q3T9V6 190 aa5.01□□□□□ -1.61
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