Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdx4Q07424 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdx4Q07424 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdx4Q07424 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdx4Q07424 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdx4Q07424 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdx4Q07424 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdx4Q07424 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdx4Q07424 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdx4Q07424 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdx4Q07424 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdx4Q07424 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdx4Q07424 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdx4Q07424 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdx4Q07424 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdx4Q07424 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdx4Q07424 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdx4Q07424 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdx4Q07424 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdx4Q07424 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdx4Q07424 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdx4Q07424 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdx4Q07424 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdx4Q07424 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdx4Q07424 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdx4Q07424 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdx4Q07424 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdx4Q07424 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdx4Q07424 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdx4Q07424 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdx4Q07424 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdx4Q07424 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdx4Q07424 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdx4Q07424 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdx4Q07424 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdx4Q07424 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdx4Q07424 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdx4Q07424 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdx4Q07424 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdx4Q07424 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdx4Q07424 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdx4Q07424 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdx4Q07424 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdx4Q07424 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdx4Q07424 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdx4Q07424 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdx4Q07424 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdx4Q07424 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdx4Q07424 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdx4Q07424 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdx4Q07424 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdx4Q07424 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdx4Q07424 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdx4Q07424 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdx4Q07424 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdx4Q07424 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdx4Q07424 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdx4Q07424 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdx4Q07424 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdx4Q07424 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdx4Q07424 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdx4Q07424 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdx4Q07424 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdx4Q07424 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdx4Q07424 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdx4Q07424 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdx4Q07424 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdx4Q07424 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdx4Q07424 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdx4Q07424 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdx4Q07424 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdx4Q07424 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdx4Q07424 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdx4Q07424 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdx4Q07424 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdx4Q07424 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdx4Q07424 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdx4Q07424 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdx4Q07424 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cdx4Q07424 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdx4Q07424 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdx4Q07424 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdx4Q07424 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdx4Q07424 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdx4Q07424 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdx4Q07424 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdx4Q07424 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdx4Q07424 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdx4Q07424 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdx4Q07424 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdx4Q07424 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdx4Q07424 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdx4Q07424 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdx4Q07424 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdx4Q07424 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdx4Q07424 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdx4Q07424 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdx4Q07424 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdx4Q07424 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdx4Q07424 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms